Ученые описали более трех миллионов однонуклеотидных полиморфизмов в геномах малярийного плазмодия

Сеть рабочих групп MalariaGEN опубликовала геномные данные 7 113 образцов малярийного плазмодия (Plasmodium falciparum), собранных в 28 эндемичных странах Африки, Азии, Южной Америки и Океании. Секвенирование проводилось на платформе Illumina. Медианная глубина покрытия составила 73 прочтения. Ученые обнаружили 3 168 721 SNP и 2 882 975 других вариаций, преимущественно коротких инделов. Почти во всех образцах присутствовали генетические признаки устойчивости как минимум к одному противомалярийному препарату. Гены, связанные с пребыванием плазмодия в организме комара, находятся в локусах, для которых характерна сильная географическая дифференциация. Расширение открытой базы геномов P. falciparum поможет изучению эволюционных механизмов плазмодия, влияющих на борьбу с малярией.

Добавить в избранное

Вам будет интересно