Меню
Все темы
Домашние кошки расселились по Европе позже, чем считалось
Считалось, что люди завезли домашних кошек (Felis catus) на территорию Европы в эпоху неолита — периода с VIII по IV тыс. лет до н.э. Публикация в Science ставит эту точку зрения под сомнение — ее авторы изучили митохондриальную и ядерную ДНК древних и современных кошек из Европы, Малой Азии и Северной Африки. Анализ 87 геномов показал, что домашние кошки были завезены в Европу около 2000 лет назад — именно тогда появляются самые ранние европейские образцы, ядерный геном которых принадлежит F. catus. Это свидетельствует о намного более позднем, чем было принято считать, расселении домашних кошек.
Возможно, домашняя кошка (Felis catus) появилась в Европе гораздо позже, чем считалось. Распространенное мнение состоит в том, что домашние кошки были завезены в Европу в эпоху неолита, хотя анализ археозоологических находок не дает этому однозначных подтверждений. Авторы статьи в Science проанализировали древнюю ДНК домашних и диких кошек и пришли к выводу, что домашняя кошка начала распространяться по европейской территории около двух тысяч лет назад.
Время одомашнивания и расселения кошек остается не до конца определенным — археологические находки достаточно скудны, а различать домашних и диких кошек только по костям затруднительно. Ученые провели палеогеномный анализ 225 образцов, найденных в археологических памятниках на территории Европы и Малой Азии. Они собрали 70 древних геномов домашних кошек и 17 геномов диких кошек из Италии (включая Сардинию), Болгарии и Северной Африки.
Возраст останков определяли методом прямого радиоуглеродного датирования. Древние образцы охватывали период с IX тысячелетия до н. э. по XIX век н. э.
Подробнее о древних образцах и их анализе
Древние образцы кошек были обнаружены в 97 местах археологических раскопок и секвенированы с низким покрытием (от 0,03× до 3,82×). Современные и музейные экземпляры диких кошек были секвенированы с низким и средним покрытием (от 0,7× до 18×).По этим данным авторы реконструировали аутосомное дерево методом максимального правдоподобия, чтобы составить филогенетическую схему современных диких и домашних кошек.
Филогенетический анализ выявил четыре основных клады, соответствующие таксонам диких кошек: степная кошка (F. lybica lybica), азиатская степная кошка (F. lybica ornata), лесная кошка (F. silvestris) и китайская кошка (Felis bieti). Степная кошка, включающая также одомашненную форму (F. catus), является сестринской кладой для трех остальных. При этом популяции F. l. lybica четко разделились на левантийских и африканских диких кошек.
Домашние кошки сформировали отдельную сестринскую кладу по отношению к африканским диким кошкам, то есть генетически они ближе к ним, чем к левантийским. Современные дикие кошки Сардинии сгруппировались с африканскими дикими кошками и образовали монофилетическую группу с экземпляром из Марокко. Она была обособлена от группы домашних кошек.
Структуру современных диких и домашних популяций авторы оценили с помощью многомерного шкалирования (MDS) на основе идентичности (identity by state) и анализа ADMIXTURE. Оба метода подтвердили топологию филогенетического дерева, а анализ F3 и F4-статистик показал, что современные домашние кошки действительно ближе к африканской, а не левантийской ветви F. l. lybica.
Какие данные указали на родство домашней кошки с африканской степной?
Как MDS, так и ADMIXTURE также выделили четыре основные клады полученного филогенетического древа и разделили группы F. l. lybica и F. catus. Домашние кошки имели больше генетического сходства с дикими кошками из Африки, особенно с тунисскими, чем с кошками из Леванта и Сардинии.Чтобы дополнительно охарактеризовать возможную историю смешения популяций, исследователи применили F3 и F4 статистики с аутгруппой. В качестве аутгруппы они использовали камышового кота (Felis chaus).
Результат показал, что все современные домашние кошки имели больше генетического сходства с современной дикой кошкой из Туниса. Тот же анализ на диких кошках Сардинии показал, что генетически они ближе к современной особи из Марокко, чем к домашним кошкам.
Ключевой вывод работы — домашние кошки все же были завезены в Европу не в эпоху неолита.
В предыдущих работах предполагалось, что в неолите на территорию Европы переселились носители митохондриальных гаплогрупп IV-A и IV-B, типичных для F. l. lybica. Авторы статьи проанализировали древние образцы, найденные в Болгарии и Малой Азии и отнесенные к гаплогруппе IV-A, — они задались целью установить их видовую принадлежность.
Результаты анализа ядерного генома расходились с данными мтДНК
Данные о том, что что в неолите на территорию Европы распространились субгруппы IV-A и IV-B, характерные для популяций F. l. lybica с Ближнего и Среднего востока, основаны на анализе однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в митохондриальной ДНК кошек. Теперь ученые провели анализ трансверсий в геномах из останков кошек, относящихся к промежутку от IX тысячелетия до III в. до н.э. — всего 22 образца.По анализу ядерного генома все они были отнесены к лесным кошкам (F. silvestris). Что интересно, среди них были восемь кошек, которые обладали мтДНК гаплогруппы IV-A, характерной для F. l. lybica. Четыре из них были найдены на территории Болгарии, еще четыре — в Малой Азии, они датировались 9900–4300 гг. до н. э. Все остальные кошки обладали как ядерным происхождением от лесной кошки, так и соответствующей мтДНК (гаплогруппа I характерна для F. silvestris).
Исследователи пришли к выводу, что неолитические кошки из Юго-Восточной Европы и Малой Азии, у которых ранее обнаружили мтДНК гаплогруппы IV-A, не относились к завезенным людьми F. catus. Они были лесными кошками, предки которых скрестились с F. l. lybica. А самый ранний образец GSA01, который обладал ядерным происхождением F. catus, — это кошка с Сардинии (Италия), датированная II веком до н. э.
GSA01 родом из предковой популяции лесных кошек
В анализе главных компонент (PCA) образец GSA01 группировался с тремя современными лесными кошками с Сардинии; их генетическая близость была подтверждена также F3-статистикой с аутгруппой. Таким образом, авторы проследили происхождение современных лесных кошек до предковой дикой популяции, обитавшей более 2 тысяч лет назад.Наконец, авторы оценили приток генов в европейские популяции кошек с помощью F4 статистики. Они показали, что в древних образцах F. silvestris с Балкан содержалось от 7 до 11% примеси F. catus или их предков, а в неолитических диких кошках F. silvestris из Малой Азии — 24–34%. Современные лесные кошки из Италии обладали промежуточным значением — 10–22%. Полученные данные демонстрируют два источника притока генов в популяцию лесных кошек: древний от популяций F. l. lybica и более современный от домашних кошек после их расселения в Европе. Это подтверждает, что смешение впервые произошло в позднем плейстоцене, до того, как человек завез в Европу домашних кошек.
Таким образом, генетическое исследование подтвердило происхождение домашней кошки — ее предком был был подвид степной кошки (F. lybica lybica). Однако полученные данные опровергают предположение о том, что ранние одомашненные кошки были завезены на территорию Европы в неолите и сдвигают время их расселения на несколько тысячелетий позже.
Источник
Вам будет интересно
159
0
1258
0
747
0
