Определена нейтрализующая активность антител после вакцинации «Спутником V» против новых вариантов коронавируса

Статистические данные для Израиля, Объединенных Арабских Эмиратов, США и Великобритании показывают резкое снижение заболеваемости и смертности от COVID-19 после того, как была вакцинирована значительная часть популяции (не менее 30 доз на 100 человек). Однако защитная эффективность вакцин против новых штаммов может снижаться.

Сотрудники НИЦЭМ им Н.Ф. Гамалеи и НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева исследовали нейтрализующую активность сыворотки крови у людей, получивших две дозы вакцины «Спутник V», против различных вариантов коронавируса, которые встречаются на территории РФ. Результаты опубликованы в журнале Vaccines.

В начале 2021 года ВОЗ объявила «вариантами, вызывающими опасения» (VOC) B.1.1.7 (альфа), B.1.351 (бета), P.1 (гамма). В мае к ним добавился вариант дельта, который относится к линии B.1.617, впервые обнаруженной в Индии. (Вложенные линии B.1.617.1 — каппа; B.1.617.2 — дельта, к которой принадлежит и «дельта-плюс» B.1.617.2.1, она же AY.1, имеющая дополнительную опасную мутацию K417N; и B.1.617.3. К VOC относится только дельта.)

Для некоторых вакцин уже проведены оценки нейтрализующей активности против VOC. В случае «британского» B.1.1.7 снижение, как правило, незначительно, однако для «южноафриканского» B.1.351 оно было существенным, в том числе для вакцин Moderna и Pfizer — в 7–8 раз. Для дельты отмечалось снижение в два-три раза, для гаммы — в 4,5 (Moderna) и в 6,7 (Pfizer). Это не означает, что во столько же раз снизилась защитная эффективность вакцины, но для предотвращения заболевания, вызванного новым штаммом, очевидно, требуются более высокие титры антител.

В начале пандемии, весной 2020 года, на территории России доминировали линии B.1 и B.1.1 (35,5% и 46,3% соответственно). Во время второй волны, в сентябре, данные из базы GISAID подтвердили появление новых линий. К февралю 2021 года 82,4% разнообразия составляли B.1.1, B.1.1.141, B.1.1.336, B.1.1.373, а также характерные для России B.1.1.317 и B.1.1.397. Первый случай инфекции «британским» B.1.1.7 в нашей стране был отмечен в январе, а в марте его частота среди секвенированных последовательностей составила 17,4%. С апреля в РФ распространяется вариант дельта, к середине июля его частота среди секвенированных геномов достигает 70%.

Образцы коронавируса авторы исследования получали в Московской городской инфекционной клинической больнице №1, от госпитализированных в мае-июне 2020 года и ноябре 2020 года — марте 2021 года. У пациентов брали мазки из носоглотки, изоляты вируса выращивали в культуре клеток и секвенировали, чтобы определить принадлежность к той или иной линии. Секвенирован был 201 образец.

Для исследования выбрали линии B.1.1.7, B.1.351, B.1.617, P.1, а также «московские» B.1.1.317 (с заменами в S-белке S477N, A522S) и B.1.1.141 (T385I). В рамках исследования были обнаружены два варианта B.1.617.2 (во время сбора материала он был еще редким).

Титры нейтрализующих антител определяли с помощью живых вирусов: это золотой стандарт, который дает наиболее точный результат. Использовали тот же метод, что и в клинических исследованиях вакцины. Образцы сыворотки, инактивированные нагреванием, разводили в пять раз, а затем получали последовательные двукратные разведения — 1:10, 1:20 и т.п. Затем образцы смешивали с вирусом в дозе 100 TCID₅₀, инкубировали, добавляли к монослою клеток Vero E6 и оставляли на 96 часов. Эффект оценивали визуально, титром нейтрализации считалось самое высокое разведение, при котором клетки были поражены лишь в одной из трех повторностей.

Также авторы получили псевдовирусы на основе лентивирусов, содержащих S-белки B.1.1.7 и B.1.351, и определили нейтрализующую активность против них. Этот метод широко распространен, поскольку требует менее жестких мер безопасности, чем работа с живым коронавирусом.

Сыворотку крови брали у вакцинированных«Спутником V» добровольцев без COVID019 в анамнезе, получивших вторую дозу за месяц до этого. Всего собрали 27 образцов.

Нейтрализующая активность сыворотки вакцинированных против «российских» линий B.1.1.141 (T385I), B.1.1.317 (S477N, A522S), а также B.1.1.7 и B.1.617.3 практически не изменилась по сравнению со «старой» B.1.1.1. Однако наблюдалось существенное снижение вируснейтрализующей активности против В.1.351, P.1, and B.1.617.2 — примерно в 3,1, 2,8 и 2,5 раза, соответственно. При этом результаты экспериментов с живыми вирусами и псевдовирусами оказались сходными. 

Авторы отмечают, что эффект был более выраженным для образцов сыворотки с изначально более низкой реактивностью.

Если судить по отношению титров, вируснейтрализующая активность снизилась меньше, чем у других вакцин, подчеркивают авторы. Однако для корректного сравнения нужны дополнительные исследования, в которых вируснейтрализующая активность образцов, полученных от привитых разными вакцинами, определялась бы одним и тем же методом.

«Становится очевидным, что при повышении коллективного иммунитета, возникшего в результате перенесенного заболевания и вакцинации, количество вариантов SARS-CoV-2 с мутациями в RBD и S-белке будет быстро увеличиваться. Некоторые из вариантов встречаются независимо в разных генетических линиях, например, N439K или E484K», — отмечают авторы в заключении. Большинство вакцин сохраняют высокую защитную эффективность против тяжелых форм заболевания, вызванных новыми вариантами. Тем не менее необходимо продолжать мониторинг

Vaccines — рецензируемый журнал с открытым доступом, основанный в 2013 году издательством MDPI из Базеля (Швейцария). Комментаторы отмечают его хорошую репутацию, несмотря на то, что недавно он оказался в центре скандала. Двадцать четвертого июня была опубликована статья, авторы которой (специалист по антионкогенному питанию, независимый специалист по анализу данных и клинический психолог) утверждали, что «вакцинация предотвращает три смерти, а вызывает две». Вывод был сделан в результате некорректных расчетов и допущений, статью вскоре отозвали, однако несколько видных ученых покинули редакцию журнала.