Особая популяция дендритных клеток кишечника защищает организм от развития пищевых аллергий
Регуляторные Т-клетки кишечника подавляют избыточный иммунный ответ на безвредные пищевые антигены, не давая развиться аллергии, однако точная схема их программирования и дифференцировки оставалась неизвестной. Авторы статьи в Nature выявили в кишечнике мышей особую популяцию Prdm16+ дендритных клеток, которые участвовали в презентации антигена периферическим регуляторным Т-клеткам и контролировали их развитие. Дисфункция таких дендритных клеток нарушала формирование толерантности к пищевым антигенам и к микробиоте кишечника.

Иммунная система должна отличать патогены от безвредных раздражителей, поскольку при «ложном срабатывании» может возникнуть аллергическая реакция. Сдерживание иммунного ответа на пищевые антигены обеспечивают регуляторные Т-клетки (Treg) в кишечнике, однако до сих пор оставалось неясно, как они программируются и какие антигенпрезентирующие клетки (АПК) участвуют в формировании пищевой толерантности. Ученые из США показали, что иммунные реакции на пищевые антигены сдерживает особая популяция дендритных клеток в кишечнике.
Ранее было показано, что в программировании периферически индуцированных Treg кишечника участвуют RORγt+ АПК. Однако оставалось неясным, требуется ли сам RORγt для развития этих АПК или выполнения ими своих функций. Чтобы это выяснить, авторы работы инактивировали его ген у мышей с помощью Cre-рекомбиназы и проанализировали, как это влияет на T-клетки кишечника. Они подсадили наивные CD4+ T клетки мышам, толстый кишечник которых был патобионтом Helicobacter hepaticus, и отследили судьбу специфичных к нему Т-клеток. Оказалось, что дифференцировка регуляторных T-клеток, ограничивающих ответ на эту бактерию, нарушалась, а в целом иммунный профиль сдвигался в сторону провоспалительного.
Для более детального анализа роли RORγt в функции АПК и дифференцировке периферически индуцированных Treg кишечника ученые провели секвенирование РНК единичных иммунных клеток, выделенных из брыжеечных лимфоузлов. Клетки получали как от контрольных, так и от мутантных мышей. Сравнение транскриптомов показало, что в отсутствие нормальной экспрессии RORγt у мышей полностью исчезал кластер Prdm16+ клеток. По всей видимости, RORγt требуется во время развития Prdm16+АПК, что делает их наиболее вероятным кандидатом в толерогенные иммунные клетки кишечника.
Затем ученые оценили доступность хроматина с помощью ATAC-seq в единичных клетках и сопоставили с транскриптомикой единичных клеток. Анализ подтвердил доступность локусов Rorc и Prdm16, а также коэкспрессию этих генов на высоком уровне. При этом количество Prdm16+ АПК незначительно увеличивалось в ходе развития мышей, от 1-недельного до 12-недельного возраста, а во взрослом возрасте стабилизируется. Такая закономерность согласуется с тем, что у взрослых мышей формируется толерантность к микробиоте кишечника, и позволяет предположить, что эти АПК сохраняют свою функциональность и после периода развития.
Дальнейший анализ транскриптомного профиля Prdm16+ АПК и их роли в иммунной системе указал на то, что они представляют собой отдельную популяцию, близко напоминающую классические дендритные клетки (ДК), но обладающую уникальной способностью индуцировать регуляторные T-клетки, специфичные к микробиоте кишечника.
После этого исследователи показали, что обнаруженные толерогенные ДК необходимы не только для сосуществования организма с его типичной микробиотой, но и для формирования толерантности к пищевым антигенам. Авторы использовали модель пищевой аллергии на овальбумин. Часть мышей предварительно кормили овальбумином, чтобы сформировать толерантность к нему, а затем проводили сенсибилизацию и вводили этот антиген внутрибрюшинно, чтобы вызвать системный ответ. Дисфункция Prdm16+
АПК не позволила развиться пищевой толерантности у мутантных мышей — их анафилактическая реакция протекала так же, как и у животных дикого типа без сформированной толерантности. Мыши дикого типа, иммунную систему которых «приучали» к овальбумину до инъекции, оказались защищены от аллергии. Эти результаты в сочетании с анализом профиля иммунных клеток указали на критическую роль толерогенных ДК в дифференцировке периферически индуцированных Treg кишечника, специфичных к пищевым антигенам.
Анализ единичных иммунных клеток, выделенных из брыжеечного лимфоузла человека и из тканей кишечника, выявил предполагаемые толерогенные АПК. Их транскриптомный профиль был похож на профиль RORγt+ Prdm16+
у толерогенных ДК мышей, что указывает на эволюционно консервативную роль этого механизма у разных видов. Детальное понимание того, как развиваются такие клетки и как они регулируют Т-клеточный ответ на пищевые и микробные антигены, может лечь в основу терапевтических стратегий для лечения аутоиммунных и аллергических заболеваний, а также оказаться полезным в трансплантологии.
Контакт с животными в младенчестве предотвращает развитие аллергии, влияя на микробиоту
Источник
Fu, L., et al. Prdm16-dependent antigen-presenting cells induce tolerance to gut antigens. // Nature (2025). DOI: 10.1038/s41586-025-08982-4