Циркадные часы бактерий устроены сложнее, чем предполагалось

Ученые из Германии, Дании и Великобритании детально описали работу циркадных часов сенной палочки Bacillus subtilis. Они охарактеризовали подстройку циркадной системы бактерии под постоянное освещение и выяснили, что ее последствия очень близки к таковым для циркадных часов эукариот.

Изображение:
Биолюминесценция Bacillus subtillis.
Credit:
Ella Baker – Jack Dorling John Innes Centre |  пресс-релиз

Под циркадными часами понимают сложные внутриклеточные молекулярные сети, изменения в которых подчиняются 24-часовому ритму. Циркадные часы есть не только у эукариот, но и прокариот, в частности, цианобактерий и некоторых нефотосинтезирующих бактерий. Однако циркадные системы у разных организмов могут существенно отличаться. Авторы новой работы, опубликованной в Science Advances, детально описали хронобиологию циркадных ритмов сенной палочки Bacillus subtilis.

В предыдущих исследованиях было выявлено наличие циркадных систем у лабораторного штамма 168 B. subtilis. Чтобы показать, что наличие циркадных ритмов свойственно B. subtilis в целом, ученые внедрили гены, отвечающие за чувствительность к синему свету в геном бактерий двух диких изолятов. Работу циркадной системы отслеживали по репортерной люциферазе, ген которой содержался в том же векторе. И в этом случае было показано, что клетки B. subtilis обладают светозависимыми циркадными ритмами.

Важнейшая характеристика циркадных ритмов — их привязка к временному интервалу. Помимо синего света, B. subtilis чувствительны к красному, и оба варианта активируют у бактерий клеточный стресс, хотя и при участии разных молекулярных механизмов. Авторы работы подвергали бактерий 24-часовому циклу освещения синим или красным светом, а в качестве ответа регистрировали биолюминесценцию клеток, экспрессировавших люциферазу. Оказалось, что пики биолюминесценции при освещении синим и красным светом различаются. Детальное изучение показало, что освещение B. subtilis синим светом снижает экспрессию чувствительного к нему белка — это детектировали по активности репортерной люциферазы и подтвердили на транскриптомном уровне. Красный свет такого воздействия не оказывал, что указывает на наличие иных механизмов регуляции в данном случае.

Чтобы оценить роль известных рецепторов красного и синего света B. subtilis в циркадных ритмах, ученые получили серию нокаутных штаммов. Оказалось, что, помимо известного рецептора синего света YtvA, у B. subtilis есть и другие, не описанные ранее синие фоторецепторы, которые дают маскирующий ответ при освещении клеток синим светом.

Авторы исследования также изучили параметр FRP (free-running period) — время, которое требуется эндогенным системам организма для того, чтобы вернуться в ту же фазу циркадного цикла в отсутствие внешних воздействий. Выяснилось, что этот показатель у B. subtilis систематически меняется в соответствии с режимом освещения. Исследователи приходят к выводу, что у B. subtilis, помимо самих циркадных ритмов, есть также способность адаптировать их к текущим условиям. Это, по-видимому, обеспечивается неким механизмом сохранения информации о предыдущих, в частности световых, воздействиях окружающей среды.

Ученые заключают, что даже такой простой прокариотический организм, как B. subtilis, обладает сложной системой поддержания циркадных ритмов и потому может стать моделью для изучения циркадных систем.


Полноценные циркадные часы цианобактерии собрали in vitro

Источник

Sartor, F. et al. The circadian clock of the bacterium B. subtilis evokes properties of complex, multicellular circadian systems. // Science Advances, published 4 August 2023, Vol 9, Issue 31, DOI: 10.1126/sciadv.adh1308.

Добавить в избранное