Коротко

Вирус гепатита E (HEV) — самая распространенная причина развития острого вирусного гепатита в мире. Механизм передачи вируса — фекально-оральный, поэтому особое место в предотвращении заболевания занимает гигиена. Ученые и специалисты в сфере производства показали, что большая часть обычных дезинфицирующих средств, содержащих этанол и пропанол, не инактивирует вирус полностью.

Обычно вирус не имеет оболочки, но в крови пациента его окружают липиды. Некоторые дезинфицирующие средства, содержащие спирт, разрушают липидную оболочку, однако это не лишает сам вирус способности к заражению. Для полной нейтрализации нужно средство, содержащее фосфорную кислоту и спирт. Это особенно важно при взаимодействии с пациентами и зараженными животными.

В American Journal of Transplantation описан случай успешной пересадки почки от донора, который погиб от тяжелой дыхательной недостаточности, связанной с COVID-19. До сих пор органы пациентов, погибших от коронавирусной инфекции, не использовались для пересадки, так как специалисты опасались передачи вируса реципиенту.

Команда из Медицинской школы при Университете Джонса Хопкинса работала с 30-летней пациенткой, которая поступила в больницу с тяжелой пневмонией и положительным ПЦР-тестом на SARS-CoV-2. Причиной ее смерти стало гипоксическое повреждение мозга. Почки функционировали стабильно все время госпитализации. Реципиент, 55-летний мужчина с терминальной стадией почечной недостаточности, получил левую почку женщины. Перед трансплантацией биопсийный образец почки проверили на наличие РНК SARS-CoV-2 с помощью гибридизации in situ и количественной ОТ-ПЦР. Ткани аорты, извлеченной при изъятии почки, также проверили на нуклеиновые кислоты вируса. Для всех тканей донора результаты тестов были отрицательными.

Реципиента тестировали на коронавирус на 20, 30 и 90 дни после пересадки почки. Почка отлично прижилась и нормально функционировала в течение по крайней мере девяти месяцев после трансплантации. По мнению авторов, риск передачи коронавируса через донорские органы (кроме легких) очень низкий, однако необходимы более масштабные исследования, а также длительное наблюдение за состоянием трансплантатов, полученных от доноров с COVID-19.

Закончился вебинар «Омикрон в России и в мире: эпидемиология, диагностика и особенности клинического течения». Дарья Даниленко, зам. директора по научной работе НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева (Санкт-Петербург), перечислила особенности штаммов коронавируса SARS-CoV-2, вызывающих обеспокоенность, от альфы до омикрона. Вариант омикрон распространяется быстрее всех ранее известных VOC, вызывает стремительный рост числа новых случаев, в частности, среди детей и подростков. Однако число тяжелых случав, по европейским данным, снижено. Важно, что омикрон генетически неоднороден — помимо наиболее известной сублинии ВА.1, распространяется конкурирующая ВА.2, и не исключено, что она может вызвать новый подъем.

Россия отстает по секвенированию геномов коронавируса: секвенируется лишь каждый тысячный случай, отметил профессор Сколтеха Георгий Базыкин. Он рассказал о том, как была расшифрована декабрьская вспышка COVID-19, в студенческом общежитии, — одна из первых «омикронных» вспышек в Санкт-Петербурге.

Герман Шипулин, заместитель генерального директора по научно-производственной деятельности ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, представил ПЦР-тест-системы, различающие варианты дельта и омикрон. Эти тесты играют важнейшую роль в мониторинге распространения штаммов, поскольку они намного дешевле, чем секвенирование. Но идентификация штамма может быть полезна и отдельным больным, поскольку клиника омикрона и дельты сильно различаются.

О клинике COVID-19, вызванного омикроном, и группах риска рассказал Александр Арутюнов, генеральный секретарь Евразийской ассоциации терапевтов. Не следует расслабляться и надеяться на легкое течение, подчеркнул он: «Любой клиницист должен держать в голове группы риска». Это прежде всего люди с избыточным весом и сопутствующими заболеваниями. К сожалению, омикрон ускользает не только от иммунного ответа организма, но и от большинства терапевтических моноклональных антител: врачи лишились мощного оружия в борьбе с COVID-19.

Подробнее об этих и других докладах PCR.NEWS расскажет в ближайшее время. Также будет доступна запись вебинара.

Международная команда ученых идентифицировала структурные вариации человеческого генома, потенциально ассоциированные с тяжестью COVID-19. Работа выполнена на образцах от 52 пациентов с тяжелой формой коронавирусной инфекции. Для поиска редких структурных вариаций ученые использовали метод оптического геномного картирования. Они обнаружили семь структурных вариаций, затрагивающих гены врожденного иммунитета и воспалительного ответа, а также гены контроля репликации и распространения вируса. Наиболее значимыми кандидатами оказались структурные вариации в генах STK26 и DPP4. STK26 экспрессируется в иммунных клетках и участвует в ответе на инфекцию. DPP4 кодирует пептидазу, которая вовлечена в активацию T-клеток. Авторы считают, что для комплексной оценки генетических детерминант тяжести COVID-19 необходимо не только секвенировать геномы, но также анализировать структурные вариации. Работа опубликована в iScience.

Национальные институты здравоохранения США (NIH) перевели почти всех подопытных шимпанзе в заповедник, где они проведут остаток жизни, сообщает NPR. Еще в 2011 году Институт медицины писал о необходимости прекращения инвазивных медицинских экспериментов на шимпанзе, так как появились новые методы, которые могут их заменить. После этого NIH отправили на покой  300 шимпанзе. В 2015 году было объявлено, что скоро за ними последуют и остальные.

Около 85 шимпанзе не могут быть переведены в заповедник из-за состояния здоровья — они страдают от сердечно-сосудистых заболеваний и диабета. Однако американское общество защиты животных считает, что и эти шимпанзе должны жить в заповеднике, а потому судится с NIH.

Пульсоксиметры широко используются для неинвазивной оценки насыщения крови кислородом. Однако на показания прибора влияет цвет кожи пациента. Авторы статьи, опубликованной в European Respiratory Journal, сравнили результаты пульсоксиметрии и анализа газового состава артериальной крови для 2 997 пациентов различного происхождения с подтвержденным COVID-19 или подозрением на него. Работа проводилась на данных из базы больниц Ноттингемского университета (Национальная служба здравоохранения, Великобритания). Сильнее всего различались показатели насыщения крови кислородом, полученные разными методами, у пациентов смешанного происхождения; наименьшие различия детектировались в группе пациентов европейского происхождения. Показатели пульсоксиметра были завышены для всех групп при сатурации, измеренной в артериальной крови, ниже 90%, и занижены при сатурации выше 95%. Особенно значительной была несогласованность результатов измерений в клинически значимом диапазоне 85–89%. Для пациентов афроамериканского, азиатского и смешанного происхождения пульсоксиметры завышали сатурацию сильнее, чем для пациентов европейского происхождения. Результаты работы не позволяют сделать вывод о вкладе ошибок пульсоксиметрии в назначение лечения пациентам с COVID-19, но авторы предупреждают, что любая задержка в оценке тяжести пневмонии может иметь неблагоприятные последствия.

Ученые из Южной Кореи разработали прозрачные самостерилизуемые воздушные фильтры, которые можно использовать при изготовлении защитных лицевых масок. Фильтры изготовлены из медных нанопроводов. Фильтр захватывает частицы, в том числе вирусы и бактерии, благодаря своим механическим и электростатическим свойствам. После этого патогены гибнут из-за олигодинамического эффекта мели. Дополнительно маска стерилизуется за счет Джоулева нагрева. Температуру фильтра можно повысить до 100°C. Ученые продемонстрировали стерилизующую способность фильтров на бактериях E. coli и G. anodireducens. Они подчеркивают, что прозрачность фильтров позволит видеть выражение лица человека — это улучшает коммуникацию. Работа опубликована в Nano Letters.

Обычно одноклеточные диатомовые водоросли размножаются бесконтрольно при благоприятных условиях. Однако недавно ученые показали, что они могут жертвовать своими интересами на благо сообщества. Когда водоросли Pseudo-nitzschia multistriata размножаются половым путем, только небольшая часть популяции непосредственно участвует в процессе. Остальные же микроорганизмы в это время сдерживают собственный рост и менее активно двигаются, чтобы снизить расход питательных веществ, даже когда ресурсов достаточно.

В результате индивидуальная диатомовая водоросль теряет возможность быстро расти, но больше нутриентов достается дочерним организмам, что выгодно для сообщества в целом. Такое поведение заставило ученых пересмотреть теории экологии планктона, которые до этого учитывали только доступность ресурсов при исследовании репродуктивного успеха одноклеточных водорослей.

Ученые из Йельского университета (США) разработали чип для детекции коронавируса в окружающем человека воздухе. Чип представляет собой устройство для пассивного отбора проб. Воздух проходит через диметилсилоксановую пленку, и вирусные частицы остаются на ней. После этого количество вирусных частиц на пленке оценивается с помощью цифровой капельной ПЦР.

После лабораторных экспериментов ученые интегрировали чипы в устройства, которые крепятся на воротник одежды, и распространили устройства среди жителей Коннектикута, ведущих различный образ жизни. Участники эксперимента носили их в течение пяти дней. Нуклеиновые кислоты коронавируса обнаружились на пяти из 62 чипов. По расчетам их владельцы подверглись воздействию 4–112 копий вирусных геномов/м³. Выше всего концентрация вируса была в ресторанах.

Ученые считают, что чип можно использовать в программах, нацеленных на раннее обнаружение потенциальных случаев COVID-19, и разработке специфичных для каждой локации рекомендаций по предотвращению трансмиссии вируса.

Работа опубликована в Environmental Science & Technology Letters.

Изображения сетчатки часто используются для мониторинга первичных заболеваний глаза и системных заболеваний, затрагивающих зрение. Ранее было показано, что на изображениях есть биомаркеры (например, плотность или извилистость сосудов сетчатки), ассоциированные с заболеваниями сердца. В новой работе международная команда исследователей обучила нейросеть оценивать массу миокарда левого желудочка и конечный диастолический объем левого желудочка и предсказывать риск инфаркта миокарда, опираясь только на изображения сетчатки и демографические данные. Для обучения использовали изображения сетчатки и сердца 5 000 человек. После обучения нейросеть с точностью 70–80% предсказывала инфаркт в течение года. По мнению авторов, диагностика заболеваний сердца по сканам сетчатки может стать альтернативой дорогостоящим исследованиям, таким как эхокардиография и МРТ.