Коротко

Правительство США запускает общенациональную инициативу по изучению пациентов с COVID-19, страдающих остаточными симптомами через несколько месяцев после выздоровления, заявил директор NIAID доктор Энтони Фаучи на брифинге в Белом доме в среду.

Ведущий национальный эксперт по инфекционным заболеваниям также раскрыл научное название нового синдрома — Post Acute Sequelae of SARS-CoV-2 (PASC). «(Есть) множество важных вопросов, на которые в настоящее время нет ответа, и мы надеемся, что с помощью этой серии инициатив мы в конечном итоге ответим», - сказал Фаучи.

Объявление было сделано после того, как исследование, опубликованное на прошлой неделе в JAMA Network Open, показало, что около трети пациентов с COVID-19 сообщают о стойких симптомах в течение 9 месяцев после болезни. Эти симптомы включали усталость, одышку, нарушения сна, лихорадку, желудочно-кишечные проблемы, беспокойство и депрессию, а также спутанность сознания.

Сеть рабочих групп MalariaGEN опубликовала геномные данные 7 113 образцов малярийного плазмодия (Plasmodium falciparum), собранных в 28 эндемичных странах Африки, Азии, Южной Америки и Океании. Секвенирование проводилось на платформе Illumina. Медианная глубина покрытия составила 73 прочтения. Ученые обнаружили 3 168 721 SNP и 2 882 975 других вариаций, преимущественно коротких инделов. Почти во всех образцах присутствовали генетические признаки устойчивости как минимум к одному противомалярийному препарату. Гены, связанные с пребыванием плазмодия в организме комара, находятся в локусах, для которых характерна сильная географическая дифференциация. Расширение открытой базы геномов P. falciparum поможет изучению эволюционных механизмов плазмодия, влияющих на борьбу с малярией.

Считается, что зубные врачи относятся к группе риска заражения коронавирусом. Однако исследование, опубликованное в Journal of Dental Hygiene, показало, что только 3,1% стоматологов США переболели COVID-19 на октябрь 2020 года. Это значение намного ниже, чем у других работников здравоохранения, и лишь немного выше, чем у населения в целом.

Впрочем, это можно объяснить тем, что более 99% опрошенных граждан подтвердили, что их стоматологические клиники приняли усиленные меры по предотвращению заражения персонала и пациентов.

Компания Moderna, производитель вакцин на основе мРНК, объявляет о завершении производства кандидатной вакцины mRNA-1273.351 против варианта SARS-CoV-2, известного как B.1.351 и впервые идентифицированного в ЮАР, для клинических испытаний. Вакцина отправлена в Национальные институты здравоохранения США (NIH), где при финансовой поддержке Национальных институтов аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID) будет проводиться фаза 1 КИ.

Хотя подтверждено, что исходный вариант вакцины Moderna (mRNA-1273) все еще обеспечивает нейтрализующую активность против вызывающих озабоченность вариантов B.1.1.7 и B.1.351, Moderna предлагает новые стратегии против этих вариантов. Во-первых, рассматривается введение бустерной вакцины в дозе 50 мкг или ниже, которая повысит нейтрализующий иммунитет. (Текущий протокол вакцины Moderna требует двух доз по 100 мкг.) Это может быть как третья доза той же вакцины mRNA-1273, так и новые разработки: mRNA-1273.351, специфичная против южноафриканского варианта, или мультивалентная вакцина mRNA-1273.211, который сочетает в себе мРНК против предковых штаммов и мРНК-1273.351.

В соответствии с недавно обновленным руководством FDA, Moderna планирует оценить иммуногенность и безопасность у невакцинированных участников, а также у тех, кто ранее получал вакцину mRNA-1273. Параллельно с исследованиями в NIH Moderna будет проводить собственные клинические исследования, чтобы затем подать нормативные документы на новые бустерные вакцины или обновленную первичную вакцину.

Центр по динамике заболеваний, экономике и политике (США) опубликовал отчет об инфекционных заболеваниях в Юго-Восточной Азии. В последние годы в регионе снизилось количество смертей, связанных с ВИЧ и малярией и улучшился охват терапией против туберкулеза, однако Юго-Восточная Азия по-прежнему вносит значительный вклад в общемировую инфекционную нагрузку. Так, эпидемия ВИЧ в Южной Азии по масштабам занимает третье место в мире, а число случаев туберкулеза составляет четверть от всех случаев. Недоедание делает популяцию Юго-Восточной Азии особенно уязвимой для забытых тропических заболеваний и «новых» (эмерджентных инфекций), таких как денге, чикунгунья и другие. В одной только Индии лекарственноустойчивые инфекции ежегодно уносят жизни 58 000 новорожденных. Пандемия COVID-19 нарушила контроль за другими инфекциями на множестве фронтов: прерваны плановая вакцинация, распространение противомоскитных сеток и противотуберкулезные мероприятия. Специалисты считают, что вместе с распространением вакцин против нового коронавируса и сдерживанием COVID-19 необходимо сосредоточиться на инфекциях, поражающих регион многие годы.

Ученые клонировали черноногого хорька — животное, которое находится под угрозой вымирания. В начале 20 века этот вид был широко распространен в Северной Америке, однако исчез после того, как сократилась численность луговых собачек — основного источника пищи хорьков. Черноногий хорек считался вымершим до обнаружения популяции в Вайоминге в 1981 году. Несколько лет популяция хорьков в этом регионе процветала, пока не стала жертвой собачьей чумы и лихорадки оленьей мухи. Сотрудники Службы охраны рыбных ресурсов и диких животных США выловили 18 оставшихся хорьков, но только семь из них передали свои гены потомству. Из-за этого существующая популяция хорьков обладает низким генетическим разнообразием.

Ученые из организации Revive & Restore надеются увеличить генетическое разнообразие за счет клонирования животных — 10 декабря 2020 года на свет появилась Элизабет Энн, клон хорька Виллы. Линия Виллы прервалась, но ее клетки были сохранены и заморожены.

Ведущий исследователь Revive & Restore Бэн Новак считает, что биотехнологии и генетические данные могут помочь в сохранении биоразнообразия. Организация также планирует возродить вымершие виды, такие как странствующий голубь и мамонт.

Ассоциация молекулярной патологии (AMP, США) обнародовала предварительные результаты опроса, посвященного молекулярной диагностике рака во время пандемии COVID-19. В опросе приняли участие сотрудники молекулярно-диагностических лабораторий. 85% респондентов указали на снижение уровня тестирования на рак в апреле, мае и июне 2020 года по сравнению с 2019 годом. В третьем квартале 2020 года снижение объемов тестирования отметили 38% респондентов, а некоторые лаборатории наблюдали их увеличение по сравнению с 2019 годом. Участники опроса рассказали о затрудненном доступе к необходимым реагентам, расходным материалам и помещениям и о проблемах, связанных с набором квалифицированного персонала. Эти обстоятельства обусловлены перераспределением ресурсов в пользу тестирования на SARS-CoV-2. AMP отмечает, что опрос проводился в то время, когда основным методом выявления коронавируса была ОТ-ПЦР. В настоящее время распространение новых вариантов SARS-CoV-2 привело к увеличению спроса на NGS, что даст дополнительную нагрузку на цепочку поставок.

Анализ ДНК позволил установить, что за чередой нападений диких животных в области залива Сан-Франциско стоит один койот, пишет San Francisco Chronicle. На прошлой неделе койот напал на трехлетнюю девочку. Мать отпугнула животное. Образцы ДНК койота были получены из ран на теле девочки. Профиль ДНК совпал с профилями образцов, полученных после трех других случаев нападения, произошедших ранее. Это означает, что на всех этих людей напал один койот. В настоящее время койота ищут для эвтаназии и тестирования на бешенство.

В понедельник, 22 февраля, FDA выпустило рекомендации для разработчиков вакцин против COVID-19 и тестов на SARS-CoV-2, учитывающие уже возникшие варианты коронавируса и возможность возникновения новых вариантов в будущем. Так, эффективность модифицированной вакцины может быть оценена по ее иммуногенности по сравнению с первой одобренной версией. Испытания модифицированной вакцины могут проводиться как на иммунологически наивных индивидах, так и на привитых исходным препаратом. Кроме того, обсуждается возможность одобрения модификаций вакцин без клинических испытаний.

Производителям тестов на SARS-CoV-2 рекомендуется минимизировать влияние известных вариантов на характеристики продукта и проводить регулярный мониторинг мутаций. При подаче заявок на регистрацию новых тестов необходимо указать, когда были собраны образцы, на которых проводилась клиническая оценка теста. Оценку необходимости дополнительной маркировки уже одобренных тестов FDA проведет совместно с производителями.

FDA также пересмотрело рекомендации для производителей моноклональных антител против COVID-19.

«Росздравнадзором зарегистрирована первая в России тест-система для определения двух мутаций, характерных для ”британского” штамма коронавируса SARS-CoV-2, методом полимеразной цепной реакции, — заявила руководитель Росздравнадзора Алла Самойлова. — Тест-система, разработанная на базе Национального исследовательского центра акушерства, гинекологии и перинатологии им. Кулакова Минздрава России совместно с компанией “ДНК-технологии”, в ходе испытаний показала высокую эффективность и достоверность результатов. Разработка и вывод на рынок первой российской тест-системы для выявления “британского” штамма коронавируса является большим успехом российских ученых».

Номер регистрационного удостоверения новой тест-системы 2021/13603. Согласно госреестру медицинских изделий Росздравнадзора, мишенями для амплификации методом ОТ-ПЦР являются участки, содержащие характерные для линии В.1.1.7 мутации в генах ORF1ab и S-белка коронавируса.

Пятнадцатого февраля 2021 года сообщалось о регистрации российской тест-системы АмплиСенс® SARS-CoV-2-UK-IT, разработанной в ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора и выявляющей мутацию N501Y, характерную для линии B.1.1.7  (номер РУ 2021/13517). По-видимому, в этом наборе используется не ОТ-ПЦР, а изотермическая амплификация LAMP. Однако на данный момент информация о нем на сайте Росздравнадзора все еще не появилась.