Летучие мыши из Китая переносят в почках потенциально патогенные вирусы

Летучие мыши — разнообразный и многочисленный отряд млекопитающих, представители которого служат естественными резервуарами для широкого спектра вирусных патогенов (сравнительные исследования показывают, что летучие мыши переносят большее разнообразие вирусов, чем многие другие группы млекопитающих). Они связаны с крупными вспышками вирусных заболеваний, в числе которых вирусы Хендра и Нипах, Марбург и Эбола, а также тяжелый острый респираторный синдром (SARS), ближневосточный респираторный синдром (MERS) и COVID-19.

Вирусы, переносимые летучими мышами, передаются человеку через прямой контакт с животными или через промежуточных хозяев; передача зачастую связана с употреблением пищи или воды, загрязненных слюной, фекалиями или мочой летучих мышей. Многие исследования сосредоточены на вироме кишечника летучих мышей и упускают из внимания вирусы, находящиеся в других тканях.

Ученые из Китая проанализировали виром почек летучих мышей — патогены могут выводиться оттуда с мочой и представлять потенциальный риск передачи. Провинция Юньнань, расположенная на юго-западе Китая и граничащая с рядом стран Юго-Восточной Азии, известна как очаг разнообразия летучих мышей и переносимых ими вирусных патогенов. В анализ включили летучих мышей именно из этого региона.

Ученые провели метатранскриптомное секвенирование тканей почек 142 особой, охватывающих десять видов летучих мышей (образцы были отобраны в период с 2017 по 2021 год). Метатранскриптомный анализ выявил разнообразное сообщество, включавшее 22 вида вирусов. Из этих видов 20 были РНК-вирусами — шесть из семейства Paramyxoviridae, три из Totiviridae, по 2 из Partitiviridae, Solemoviridae и Narnaviridae, и по 1 из Phenuiviridae, Chuviridae, Nodaviridae, Picornaviridae и Tombusviridae. Также исследователи обнаружили один ДНК-вирус семейства Parvoviridae и один представитель Hepadnaviridae. Из 22 видов 20 были идентифицированы впервые, причем лишь девять видов были родственны известным вирусам млекопитающих.

Особое внимание ученые обратили на два недавно идентифицированных хенипавируса, которые родственны опасным человеческим патогенам —вирусам Хендра и Нипах. Самая высокая концентрация хенипавирусов детектировалась именно в почках летучих мышей, и это позволяет предположить, что они являются основным местом репликации хенипавируса внутри хозяина.

Помимо вирусов, ученые обнаружили в почках летучих мышей бактерий недавно идентифицированного вида Flavobacterium yunnanensis и Phyllobacterium calauticae. Анализ паттерна экспрессии генов показал, что эти бактерии метаболически активны в хозяевах-летучих мышах, однако их биологическое значение для летучих мышей остается неясным. Высокая распространенность в тканях может указывать на патогенную роль. Интересно, что в предыдущих исследованиях было показано наличие бактерий рода Leptospira в почках летучих мышей, но в данной работе их не выявили. Ученые объясняют это расхождение возможной малочисленностью бактерий.

Кроме того, авторы обнаружили новый вид паразитических простейших, предварительно названный Klossiella yunnanensis и родственный паразиту Klossiella equi, который инфицирует почки лошадей. Патогенность этого простейшего для людей или даже летучих мышей остается неясной.

Вирусы из семейств Totiviridae и Narnaviridae (уже известно, что их представители заражают широкий спектр беспозвоночных хозяев), обнаруженные в большом количестве в почках летучих мышей, оказались связаны с K. yunnanensis, а не с самими летучими мышами. Это подчеркивает важность анализа всего инфектома для лучшего выяснения взаимодействий между вирусами внутри животного и их потенциальной связи с первичным хозяином.

Новые органоиды из клеток летучих мышей подходят для изучения зоонозных вирусов с пандемическим потенциалом