Создан антигенный микрочип для выявления переболевших COVID-19

В базе bioRxiv появился препринт, в котором ученые из США рассказывают об эффективности разработанного ими микрочипа для детекции антител к различным коронавирусам, включая SARS-CoV-2, SARS-CoV и MERS-CoV. Специфичность теста оценивалась на плазме людей, переболевших COVID-19, и плазме, полученной до начала пандемии.

Credit:
Dotted Yeti | Shutterstock.com

В настоящее время в большинстве стран тесты на основе ПЦР применяются для диагностики коронавирусной инфекции у людей с симптомами заболевания и у людей из группы риска. Такой подход занижает число переболевших. Кроме того, чувствительность тестов составляет всего 60–80%, а их эффективность зависит от правильности забора пробы и титра вируса у пациента.

Чтобы достоверно оценить процент зараженных людей, необходимо проводить серологические тесты для определения антител к патогену, однако оптимальная комбинация вирусных антигенов для точного анализа пока неизвестна. Ученые из США и Швейцарии разработали микрочип, содержащий 67 антигенов SARS-CoV-2 и других известных коронавирусов, каждый в четырех повторностях. В панель антигенов включены белки нуклеокапсида (NP) и S-белки как в виде отдельных доменов S1 и S2, так и в виде полного белка. Для проверки микрочипа использовали два типа плазмы: реконвалесцентную плазму от пациентов с диагнозом COVID-19, подтвержденным ПЦР-тестом, как положительный контроль и плазму, полученную еще до начала эпидемии, как отрицательный.

Микрочип продемонстировал свою эффективность для детекции антител, специфичных именно к SARS-CoV-2. Кросс-реактивность антител к белкам нуклеокапсида наблюдалась только между SARS-CoV-2 и SARS-CoV, но не MERS-CoV или сезонными коронавирусами, несмотря на высокую гомологичность NP-белков у бета-коронавирусов. Кроме того, выяснилось, что количественное различие между связываемостью антител к S2-домену SARS-CoV-2 в группах положительного и отрицательного контроля достаточно велико, что позволяет эффективно различать плазму переболевших и неинфицированных людей.

Микрочип может быть полезен как для диагностики, так и для эпидемиологических исследований. Высокопроизводительное и надежное обнаружение специфических антител к SARS-CoV-2 важно для точной оценки истинной распространенности заболевания.

Источник

Rafael R de Assis, et al. // Analysis of SARS-CoV-2 Antibodies in COVID-19 Convalescent Plasma using a Coronavirus Antigen Microarray. // bioRxiv, posted April 17, 2020; DOI: 10.1101/2020.04.15.043364
Добавить в избранное

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.