Коротко

У двоих пациентов, переживших длительную коронавирусную инфекцию, выявили вариант SARS-CoV-2 с мутацией V792I, которая делают его резистентным к ремдесивиру. Эти люди — реципиенты почек, получавшие препараты, которые подавляют иммунную систему. При этом изначально пациенты были заражены коронавирусом, не имевшим этой мутации. О том, что мутация V792I делает коронавирус резистентным к ремдесивиру, было известно на основании ранних лабораторных экспериментов.

Оба пациента были привиты против коронавируса еще до операции, однако все равно заболели. Симптомы продолжались несколько месяцев; пациентов лечили ремдесивиром. Через несколько недель после лечения симптомы вернулись, но оба пациента пережили болезнь. Однако, когда исследователи проанализировали коронавирус, выделенный у пациентов, то обнаружили мутацию V792I, которая отсутствовала до лечения. Авторы подчеркивают необходимость мониторинга изменений, которые происходят в геноме коронавируса со временем.

Фармацевтические компании заявляют, что цены на их лекарства так высоки, потому что нужно оправдать затраты на их разработку. Но исследователи из США и Великобритании продемонстрировали, что это не так. Они рассмотрели 60 терапевтических агентов, одобренных FDA с 2009 по 2018 годы, и показали, что связи между инвестициями в разработку препарата и ценой курса лечения нет. Авторы работы основывались на данных FDA и SSR Health. Они говорят, что фармкомпании должны раскрыть больше данных, если хотят оправдать свои цены стоимостью разработки препаратов. 

Исследователи рассматривали инвестиции в разработку препаратов и стоимость курса лечения (цена за год терапии хронических состояний или цена максимального рекомендованного срока лечения). При этом цену препарата брали на момент запуска, через год после запуска и на 2021 год. Корреляционный коэффициент учитывал другие факторы, такие как орфанный статус заболевания. Использовали две модели, но ассоциации между затратами на разработку и ценой препаратов не было обнаружено.

Система для цитометрии Cellaca PLX дает возможность оценивать различные критические характеристики качества (CQA) образцов клеток в рамках автоматизированного рабочего процесса, что позволяет оптимизировать научные эксперименты и производственные процессы в области клеточной и генной терапии. Интенсивного обучения или сложных процедур калибровки не требуется.

Cellaca PLX Image работает с наборами реагентов от подразделения BioLegend компании-разработчика прибора PerkinElmer. Дополнительные возможности позволяют одновременно обнаруживать несколько маркеров (мультиплексирование) и выполнять иммунофенотипирование клеток, а также анализ жизнеспособности за несколько секунд.

«Хотя платформа Cellaca PLX Image Cytometer не привязана к определенной терапевтической области, ожидается, что она будет особенно полезна для исследователей, работающих в области CAR-T-клеточной терапии, которые хотят упростить фенотипирование иммунных клеток для последующих процессов», — заявил Ален Флетчер, старший вице-президент по наукам о жизни компании PerkinElmer.

Подразделение PerkinElmer Nexcelom — поставщик технологий автоматизированного подсчета клеток и оборудования для цитометрии. Ранее оно вывело на рынок высокопроизводительный автоматический счетчик клеток Cellaca MX.

Национальные институты здравоохранения США запускают программу, цель которой — установление функций всех человеческих генов, каталогизация молекулярных и клеточных последствий инактивации каждого из них. В настоящее время хорошо изучено чуть более 6000 из примерно 19000 генов, кодирующих белки, при этом и для них хорошо охарактеризована только часть функций.

Первая фаза программы «Молекулярные фенотипы нулевых аллелей в клетках» (MorPhiC) под руководством Национального института исследования генома человека (NHGRI) будет сфокусирована на 1000 генов, кодирующих белки. У этой пилотной фазы три задачи: изучение методов нокаута генов; разработка молекулярных и клеточных систем, моделирующих ткани человека и стадии развития; разработка воспроизводимых молекулярных и клеточных подходов к каталогизации функций генов. Затем будет начата вторая фаза с более обширным набором генов.

Проекты, финансируемые MorPhiC, будут изучать функции белков путем создания нулевых аллелей — вариантов генов, которые не кодируют работающий белок. Сложность в том, что многие гены мультифункциональны, их эффекты и активность меняются в зависимости от типа клеток и тканей, в которых они экспрессируются, полученных клеткой сигналов, возраста человека и факторов окружающей среды. Исследования будут проводиться на различных моделях, включая органоиды — трехмерные «мини-органы», которые состоят из нескольких типов клеток и имитируют функции человеческих тканей и органов.

Пять исследователей выиграли финансирование первой фазы программы MorPhiC: Мажар Адли из Медицинской школы Файнберга Северо-Западного университета, Люк Гилберт из Калифорнийского университета в Сан-Франциско, Данвэй Хуанфу из Института исследования рака Слоана—Кеттеринга, Пол Робсон из лаборатории Джексона и Стефан Шюрер из Университета Майами. Финансирование общей суммой 42,5 миллиона долларов рассчитано на пять лет.

На онлайн-совещании с разработчиками средств диагностики представители Управления по контролю продуктов и медикаментов США (FDA) призвали выпустить на рынок высокочувствительные безрецептурные тесты для молекулярной диагностики оспы обезьян, чтобы увеличить охват тестированием в стране. Все типы анализов на это инфекционное заболевание смогут пройти ускоренную процедуру одобрения на применение в экстренной ситуации.

Вирус оспы обезьян впервые был зарегистрирован в США в мае 2022 года. Когда к августу число новых случаев заражения достигло 400 в день, власти объявили о чрезвычайной ситуации в области общественного здравоохранения.

Компания Quest Diagnostics 7 сентября 2022 года первой получила одобрение FDA для экстренного применения своего теста на оспу обезьян. Тест на основе ПЦР в реальном времени выявляет ДНК оспы обезьян и других ортопоксвирусов, не связанных с натуральной оспой. Ранее для выявления оспы обезьян в США использовался тест на ортопоксвирусы, разработанный в CDC. Для оценки эффективности нового анализа, по словам представителей FDA, разработчики могут получить остаточные материалы образцов из лабораторий CDC. В дальнейшем появится больше тестов для сравнения.

FDA также составляет руководство по созданию экспресс-тестов на антигены оспы обезьян. Разработчикам рекомендовано связаться с Национальными институтами здравоохранения, объявившими о планах ускорить процессы валидации, получения разрешений и коммерциализации тестов для анализа в местах оказания медицинской помощи и в домашних условиях. Прием заявок по этой программе начался с 7 сентября.

Люди, которые пьют 2–3 чашки кофе в день (растворимого, молотого или декофеинизированного), реже страдают от сердечно-сосудистых заболеваний и живут дольше, чем люди, не пьющие кофе. Исследование было опубликовано в журнале European Journal of Preventive Cardiology. Авторы проанализировали данные 449 563 человек из UK Biobank со средним возрастом 58 лет, не страдающих от сердечно-сосудистых заболеваний при наборе. Участники заполняли опросник о потреблении кофе, после чего их разделили по группам: не пьющие кофе, пьющие меньше одной чашки, одну, 2–3, 4–5 и более пяти чашек в день. Также учитывались возраст, пол, этническая группа, ожирение, гипертензия, диабет, обструктивное апноэ сна, курение, потребление чая и алкоголя.

Здоровье участников отслеживали в среднем 12,5 лет, 27 809 человек (6,2%) умерли за это время. Люди, пьющие кофе, умирали реже; сильнее всего риск снижался в группе, пьющей 2–3 чашки в день. Если человек пил декофеинизированный кофе, то риск смерти снижался на 14%, молотый — на 27%, растворимый — на 11%. Также уменьшался риск развития сердечно-сосудистых заболеваний. В группе, пьющей 2–3 чашки в день, риск снижался на 6%, 20% и 9% при потреблении декофеинизированного, молотого и растворимого кофе соответственно. Авторы говорят о том, что, кроме кофеина, этот напиток содержит более сотни биологически активных веществ, которые потенциально могут приносить пользу организму.

Артрит — воспаление суставов — имеет различные причины, и для назначения правильного лечения важно определить, от какого типа артрита страдает человек. К сожалению, это не так просто, и зачастую диагноз можно поставить только с прогрессированием заболевания. Немецкие исследователи научили искусственный интеллект (ИИ) распознавать типы артрита — ревматоидный (серопозитивный и серонегативный) или псориатический — по изображениям, полученным с помощью магнитно-резонансной томографии (МРТ). ИИ был успешен в 75% случаев. Ранее та же команда добилась хороших результатов с помощью изображений, полученных методом компьютерной томографии.

Для тренировки и тестирования нейронной сети использовали изображения 649 пациентов, полученные с помощью МРТ. Авторы полагают, что ИИ детектирует ранние изменения, которые еще не были описаны. Они продолжают тренировать свою сеть, готовя ее к применению в клинической практике.

Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) выделили $90 млн на создание сети Центров передового опыта в области геномики патогенов (Pathogen Genomics Centers of Excellence, PGCoE). Эти деньги пойдут на финансирование пяти государственных лабораторий общественного здравоохранения и академических институтов-партнеров в течение следующих пяти лет. PGCoE будут создавать и внедрять инновации в области геномики патогенов, молекулярной эпидемиологии и биоинформатики с целью предотвращения, контроля и ответа на угрозы общественному здравоохранению со стороны патогенных микробов.

Среди этих государственных лабораторий — Департамент общественного здравоохранения штата Джорджия, Департамент здравоохранения штата Миннесота, Департамент общественного здравоохранения штата Массачусетс, Подразделение объединенных лабораторных услуг штата Виргиния и Департамент здравоохранения штата Вашингтон. В сеть PGCoE также войдут академические институты, в том числе Университет штата Джорджия, Институт Бродов, Клиника Майо, Университет Вирджинии и Вашингтонский университет.

Коронавирусная инфекция ассоциирована с повышенным риском развития диабета 1 типа у детей и подростков. Доклад на эту тему был представлен норвежскими учеными и коллабораторами на ежегодной встрече Европейской ассоциации по изучению диабета, прошедшей в Стокгольме 19–23 сентября 2022 года. Авторы изучили данные более 1,2 млн проживающих в Норвегии индивидов младше 18 лет, собранные за два года. Они показали, что абсолютный риск развития диабета 1 типа возрос с 0,08% до 0,13%, то есть все еще остается низким. Тем не менее исследователи советуют педиатрам и родителям внимательнее отнестись к возможному проявлению симптомов диабета.

В исследовании учитывались новые случаи диабета, диагностированного в течение 30 дней от положительного ПЦР-теста на SARS-CoV-2. Детей, переболевших COVID-19, сравнивали с теми, у кого коронавирусная инфекция не была диагностирована. Всего за два года были выявлены 424 354 случая COVID-19 и 990 новых случаев диабета 1 типа. Риск развития диабета возрос на 60%, если учесть возраст, пол, страну происхождения, регион проживания и социально-экономические факторы. Причина остается неясной, хотя ранние исследования показали, что SARS-CoV-2 может атаковать бета-клетки, производящие инсулин. Авторы с осторожностью подходят к интерпретации данных и говорят о необходимости дополнительных исследований.

Сколько раз, приходя к врачу, мы слышали диагноз «ОРВИ». За этими буквами может прятаться любой из сотен патогенов: рино- и аденовирусы, вирусы гриппа и парагриппа, различные типы коронавирусов, бока- и метапневмовирус, респираторно-синцитиальный вирус и многие другие. В большинстве случаев при легком течении болезни возбудитель не определяют, назначая симптоматическое лечение. Однако в некоторых ситуациях необходимо выявить конкретный патоген, вызвавший развитие заболевания. Для дифференциального определения возбудителей ОРВИ широко применяется метод ПЦР. Установление диагноза на ранних этапах болезни позволяет назначить специфические средства этиотропной терапии, а также прогнозировать тяжесть течения заболевания, возможные осложнения и исходы болезни.

PCR.NEWS и АО «Вектор-Бест» приглашают на вебинар «Метод ПЦР в дифференциальной диагностике ОРВИ», который состоится 27 сентября в 10:00 (МСК). Юлия Эдуардовна Томилова, научный сотрудник лаборатории ПЦР АО «Вектор-Бест», рассмотрит особенности течения инфекций и алгоритмы ПЦР-диагностики ОРВИ, а также ответит на вопросы.

Дата: 27 сентября

Время: 10:00 МСК

Ссылка для подключения: https://youtu.be/c4khn5Gb86Q