Коротко

Компании SkyGen и 10x Genomics проведут вебинар, посвященный технологиям Chromium Single Cell и Visium. Вебинар состоится 11 июня 2020 года в 15.00 (МСК).

10x Genomics предлагает технологии для анализа геномов и транскриптомов единичных клеток с помощью NGS-секвенирования. Технология Visium для анализа распределения экспрессионных профилей клеток в пространстве, как и другие протоколы компании, представляет собой готовое решение и включает все необходимое, от слайдов для визуализации образцов и захвата транскриптов до программного обеспечения для обработки данных.

Chromium Single Cell — технология анализа геномов и транскриптомов единичных клеток. С помощью специально разработанной системы пробоподготовки одиночные клетки или молекулы ДНК инкапсулируют в эмульсионные капли с гелевыми частицами, каждая из которых содержит уникальный баркод для мультиплексирования. В итоге получают баркодированные нуклеиновые кислоты единичных клеток для последующей подготовки NGS-библиотек, совместимых со всеми моделями секвенаторов Illumina. Подобная технология может использоваться как для анализа экспрессии генов, так и для высококачественной сборки de novo.

Партнерский материал

Как сообщает официальный Telegram-канал оперативного штаба Правительства Ярославской области по ситуации с коронавирусом, на базе Ярославского госпиталя ветеранов войн проходят исследования трех препаратов против COVID-19: «Олокизумаба», «Авифавира» и «Галавита».

«Олокизумаб» — это гуманизированное моноклональное антитело, блокирующее ИЛ-6, изначально разработанное как средство против ревматоидного артрита. Он считается перспективным для снятия чрезмерного воспаления при тяжелой форме COVID-19. «Авифавир» — первый российский препарат против коронавирусной инфекции, аналог фавипиравира, зарегистрированный в конце мая. По словам главного внештатного пульмонолога департамента здравоохранения и фармации Ярославской области Николая Пояркова, больные, участвующие в исследованиях, хорошо переносят терапию новыми препаратами. Исследования рассчитаны как минимум на месяц. Две недели пациенты должны наблюдаться в стационаре, а затем еще две недели дома.

«Галавит» — это иммуномодулятор, который рассматривается как средство профилактики COVID-19. В его испытаниях, которые начались 3 июня 2020 года, принимают участие сотрудники медицинских организаций, работающие в условиях большой вирусной концентрации. Предварительная оценка эффективности «Галавита» будет проведена после 10 дней приема препарата.

На базе клинической больницы №85 ФМБА России создан Координационный центр по заготовке и клиническому применению антиковидной патогенредуцированной плазмы. Координационный центр обрабатывает информацию от медицинских организаций; действует круглосуточный call-центр. Специалисты подразделения направляют потенциальных доноров на обследование, чтобы принять решение о возможности донации. Заготовку плазмы в КБ №85 ФМБА России проводит выездная бригада Центра крови ФМБА. Плазма проходит процедуру патогенредукции и заморозку. Метод патогенредуцкии позволяет исключить передачу гемотрансмиссивных инфекций, не выдерживая плазму на карантине. Кроме того, кровь донора проходит лабораторные исследования за два дня до донации и в день заготовки плазмы, в ходе которых помимо прочего проверяется наличие маркеров гемотрансмиссивных инфекций. Заготовкой, хранением и обеспечением безопасности антиковидной патогенредуцированной плазмы в регионах также занимаются КБ №122 им. Л.Г. Соколова ФМБА России, СКФНКЦ ФМБА России и ФСНКЦ ФМБА России.

Как сообщает Минобороны России, для проверки безопасности и эффективности рекомбинантной вакцины против COVID-19, разрабатываемой 48 Центральным научно-исследовательским институтом войск РХБ защиты совместно с НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи, отобрано 50 военнослужащих, в том числе пять женщин. Все участники прошли предварительное обследование, по результатам которого признаны здоровыми. Клиническое исследование пройдет на базе 48 ЦНИИ Минобороны РФ. На 3 июня 2020 года назначен заезд первой группы добровольцев в медучреждение при 48 ЦНИИ, где будет проходить углубленное медицинское обследование и подготовка к эксперименту. Завершить исследование планируется до конца июля 2020 года.

В ходе исследования, опубликованного в The Lancet, ученые наблюдали пациентов c COVID-19 и необходимостью хирургического вмешательства в связи с онкологическими заболеваниями, травмами, доброкачественными новообразованиями и т. д. Послеоперационные осложнения на легкие (пневмония, ОРДС, неожиданная потребность в ИВЛ) детектировались у 577 из 1 128 участников (51,2%). 268 человек (23,8%) умерли в течение 30 дней после операции, при этом две трети смертей составили пациенты с осложнениями (219 из 577). С плохим исходом были ассоциированы такие факторы, как мужской пол, возраст 70 лет и старше, сопутствующие заболевания, хирургическое вмешательство, связанное с раком, а также срочные или обширные операции. При этом частота осложнений и летальных исходов даже для групп высокого риска была значительно выше этих показателей до пандемии. Ученые считают, что необходимо пересмотреть показания к хирургическому вмешательству на время пандемии COVID-19, особенно для пожилых людей. Следует как можно дольше откладывать несрочные операции, делая упор на нехирургическое лечение.

23 мая сообщалось, что за неделю более 50 тысяч жителей столицы прошли тесты на иммунитет к коронавирусу, и у 12,5% были обнаружены антитела. Такой результат стал аргументом за смягчение ограничительных мер в городе. Количественное определение IgM- и IgG-антител к SARS-CoV-2 в медицинских учреждениях Москвы проводится с помощью систем иммунохемилюминесцентного анализа (ИХЛА) китайской компании Mindray Medical для выявления антител IgG и IgM к SARS-CoV-2 на анализаторах той же компании. В настоящее время пройти бесплатное тестирование в Москве может любой желающий, и спрос на эту услугу очень велик. Как пояснила заместитель мэра Анастасия Ракова, мощность 30 точек в городских поликлиниках — 5000 тестов в день.

«Инвитро» сообщила 27 мая, что 16,5% жителей Москвы, прошедших в компании исследование на антитела к SARS-CоV-2, получили положительный результат. Аналогичный показатель для других регионов России, в которых доступно данное исследование, — 11,4%. Тестирование проводится методом иммуноферментного анализа (ИФА) на тест-системах отечественных и иностранных производителей, упоминалась в том числе тест-система ФГБУ «НМИЦ гематологии». Компания также обещает создать на своем сайте раздел, где будет публиковаться в реальном времени общее число пациентов, выполнивших исследование на антитела к SARS-CoV-2, и число положительных результатов.

Аналогичный раздел есть на сайте компании «Генетико», которая использует собственный тест CoronaPass. По данным на 1 июня в группе врачей, медработников, а также доноров — антитела IgG у 9%, IgM у 2,2%, присутствуют оба типа антител у 15%, в сумме 25,2%. Среди обычных пациентов, прошедших тестирование по собственному желанию, — IgG выявлены у 6%, IgM у 2,4%, присутствуют оба типа антител у 7,7%, в сумме 16,1%.

Российский фонд прямых инвестиций и группа компаний «ХимРар» 30 мая 2020 года объявили о регистрации в России противовирусного препарата «Авифавир». Препарат создан на основе фавипиравира и сейчас проходит финальный этап клинических исследований с участием 330 пациентов с COVID-19.

Препарат Артлегиа (олокизумаб), производящийся российской группой компаний «Р-Фарм» по лицензии UCB, 21 мая также получил регистрационное удостоверение. Олокизумаб — это гуманизированное моноклональное антитело, блокирующее ИЛ-6, изначально разработанное как средство против ревматоидного артрита. В апреле Минздрав РФ одобрил проведение клинических исследований эффективности и безопасности олокизумаба для пациентов с тяжелой формой COVID-19.

Ранее, 14 мая, «Р-Фарм» получила разрешение на проведение в России клинических исследований радотиниба в партнерстве с корейской компанией Il-Yang Pharmaceuticals. Радотиниб — это низкомолекулярный ингибитор тирозинкиназы Bcr-Abl. Он был зарегистрирован в Южной Корее в 2012 году как средство для длительной терапии пациентов с миелоидным лейкозом. Как сообщает «Р-Фарм», активность радотиниба против коронавирусов in vitro была продемонстрирована еще в 2010-х гг. Клиническое исследование безопасности и эффективности радотиниба при COVID-19 пройдет в 13 медицинских учреждениях на территории РФ; в нем примут участие 180 пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.

На пресс-брифинге 25 мая генеральный директор ВОЗ Тедрос Аданом Гебреисус объявил о приостановке исследований хлорохина и гидроксихлорохина в рамках программы Solidarity. Поводом к этому послужила публикация в The Lancet, согласно которой среди пациентов с COVID-19, получавших хлорохин или гидроксихлорохин отдельно или в комбинации с макролидом, повышен, а не снижен.

Хлорохин и гидроксихлорохин включены в шестую версию Временных методических рекомендации «Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)», утвержденные Минздравом РФ. 28 мая на сайте Министерства появилось сообщение с комментариями о назначении гидроксихлорохина при COVID-19 в России. В нем говорится, что рекомендации по применению этого препарата основаны на результатах многочисленных зарубежных исследований, подтвердивших его эффективность. Так как один из побочных эффектов гидроксихлорохина — нарушение сердечного ритма, Временные рекомендации содержат указание о контроле состояния сердца у больных, получающих этот препарат, а также о недопущении назначения препарата пациентам с высоким риском развития аритмий. По данным мониторинга безопасности гидроксихлорохина в период пандемии COVID-19, в России не выявлено летальных случаев, связанных с приемом этого препарата.

Минздрав РФ завершает подготовку седьмой версии Временных методических рекомендаций по диагностике, профилактике и лечению COVID-19. В них будут включены дополнительные критерии для оценки пользы и риска использования гидроксихлорохина в каждом конкретном случае, а также меры по мониторингу и профилактике аритмий в период лечения.

Постановление главного государственного санитарного врача о правилах профилактики COVID-19 опубликовано на официальном интернет-портале правовой информации. Документ действует до 1 января 2021 года. В частности, в нем отмечено, что «лица, прибывшие из неблагополучных по COVID-19 регионов, изолируются в домашних условиях в течение 14 календарных дней со дня прибытия». Будут продолжены мониторинг заболеваемости, слежение за циркуляцией и распространением коронавируса, «мониторинг напряженности иммунитета среди переболевших лиц». Перечислены приоритеты назначения лабораторных исследований, правила их проведения и подтверждения.

С 27 мая в Москве все желающие могут пройти ИФА-тестирование на наличие антител IgG и IgM к COVID-19 по предварительной записи.

Минздрав России утвердил Методические рекомендации по кодированию и выбору основного состояния в статистике заболеваемости и первоначальной причины в статистике смертности, связанных с COVID-19. В основу рекомендаций положены новые принципы, установленные Международной классификацией болезней Всемирной организации здравоохранения (МКБ-10) с учетом Международных методических рекомендаций по удостоверению и кодированию COVID-19 в качестве причины смерти, сообщается на сайте министерства.

Согласно рекомендациям, в случаях, связанных с коронавирусом, при наличии нескольких заболеваний в качестве основного должно быть выбрано более тяжелое состояние. (При летальном исходе в посмертном заключительном клиническом диагнозе основное заболевание, как правило, выбирается в качестве первоначальной причины смерти.) Инфекция COVID-19 без связанных с ней смертельных осложнений не считается причиной смерти при экстренных хирургических вмешательствах, острых заболеваниях, таких как инфаркт миокарда. Однако при сочетании COVID-19 с хроническими заболеваниями (постинфарктный кардиосклероз, диабет, ожирение) первоначальной причиной следует выбирать не их, а COVID-19. Ошибкой является указание причины смерти без указания осложнений, приведших к летальному исходу. Кроме того, «в соответствии с обновлениями ВОЗ 2016 года, при выборе первоначальной причины смерти ОТКЛОНЯЮТСЯ последовательности, в которых COVID-19 считается СЛЕДСТВИЕМ любого другого заболевания или состояния, включая болезнь, вызванную ВИЧ, злокачественные новообразования и состояния, ослабляющие иммунную систему».