МД-2025: Новинки оборудования для NGS, автоматизации и генетической масс-спектрометрии

erid:2Vfnxvke5W9

Представитель компании «ИнтерЛабСервис» Джафаров Маис Илкин оглы рассказал о новых секвенаторах NGS, о приборах для проведения ПЦР и генетической масс-спетрометрии и о решениях для автоматизации молекулярно-генетических лабораторий.

Секвенаторы

Китайская компания Sikun, основанная в 2020 году, к 2023 году представила свою первую полноценную платформу для NGS. Сегодня в ее портфолио — три прибора с разной производительностью; в Китае установлено больше сотни приборов компании, и большая часть работает в области медицины.

Технология секвенирования в приборах Sikun сходна с той, что применяется в NGS-секвенаторах Illumina (секвенирование методом синтеза), и использует двухцветную химию. Максимальное количество циклов секвенирования — 600. Минимальное качество данных секвенирования Q30 — 85%. Процесс запуска секвенатора упрощен: пользователю достаточно добавить подготовленную библиотеку в картридж с реагентами.

Набор реактивов для секвенирования на платформах Sikun включает картриджи с необходимыми буферами и реагентами. Сейчас химия улучшена и стабилизирована: начиная со следующего года все новые реактивы будут иметь срок годности 12 месяцев. Проточная ячейка также модифицирована для ультравысокой плотности P5 и P7 праймеров, что увеличивает выход данных с одной ячейки.

В Китае наиболее популярен прибор Sikun 2000. Примечательно, что «старшие» приборы могут использовать наборы «младших», так, на Sikun 2000 можно использовать реактивы для Sikun 500 и 1000.

На всех секвенаторах линейки есть режим быстрого секвенирования. Он сокращает время секвенирования в два раза, при этом качество данных ухудшается незначительно — максимум на 5%. Например, на тестах у производителя качество ухудшалось всего на 2–2,5%.

Приборы имеют высокую пропускную способность. Также в начале следующего года появится возможность автоматической индивидуальной загрузки библиотек на дорожки ячейки, что позволит проводить несколько типов исследований за один запуск прибора.

В научной периодике уже опубликованы результаты сравнения качества работы Sikun 2000 с приборами от другого производителя — NovaSeq X и NovaSeq 6000. Для сравнения приборов авторы исследования отсеквенировали пять человеческих геномов. Sikun 2000 отлично справился с точным выявлением SNV, но оказался чуть хуже в выявлении инделов по сравнению с платформами NovaSeq. При этом Sikun 2000 продемонстрировал хорошее качество данных: количество плохих прочтений у него составило 0,0088% против 0,8338% у NovaSeq 6000 и 0,0088% против 0,9780% у NovaSeq X.

Производитель секвенаторов Sikun в своих решениях для секвенирования делает акцент на микробиологии и вирусологии. От самого производителя доступны решения для секвенирования бактерий и вирусов de novo, для ресеквенирования, а также для таргетного секвенирования бактерий по 16S РНК. Производитель сотрудничает с различными китайскими компаниями, выпускающими решения и для других применений, в том числе для задач онкологии, метагеномики и т.д.

Отдельно был упомянут более компактный секвенатор Sikun RapidGS480 с производительностью от 0,5 до 48 Гб. Его отличительные особенности — гибкость химии и возможность проводить быстрое секвенирование. Этот секвенатор ожидается на рынке в первом квартале 2026 года. Кроме того, компания Sikun занимается производством еще более высокопроизводительных систем, чем Sikun 2000.

Автоматизация

Далее были представлены решения для автоматизации рутинных процессов в молекулярно-генетических лабораториях от китайской компании NAYO Biotechnology. Компания выпускает автоматические дозирующие станции A8 Pro, доступные в «короткой» и «длинной» версии, которые отличаются по габаритам и вместительности: в «короткую» станцию можно установить до 4 дозаторов, а в «длинную» — до 8. Диапазон дозирования в этих станциях — от 1 до 1000 мкл, при этом дозирование проводится с высокой точностью. Для обеспечения стерильности в станции можно устанавливать УФ-лампу и HEPA-фильтр.

Управление станцией производится со встроенного сенсорного компьютера. На него загружаются и запускаются любые пользовательские протоколы.

Помимо дозаторов есть возможность установки в прибор дополнительных модулей: модуль шейкирования, в том числе с подогревом, термоциклер и т.д. В базовой конфигурации прибора под NGS пропускная способность станции — 24 образца, при этом есть конфигурации, рассчитанные на пропускную способность до 96 образцов.

Точность работы станции обеспечивается за счет сервомотора и особой конструкции крепления манипуляторов. Благодаря особому типу подключения дозаторов — POGO-pin — они крепятся быстро и надежно.

Компания также разработала более компактную дозирующую станцию NAYO A8 mini — у нее нет собственной внешней «оболочки». Она подходит для лабораторий, в которых нет больших потоков. За счет ее размеров станцию можно поместить в бокс для соблюдения стерильности, если есть такая необходимость.

ПЦР и масс-спектрометрия

В заключение Маис Джафаров рассказал о решениях для ПЦР и для альтернативной технологии — генетической масс-спектрометрии. Таргетное секвенирование сегодня автоматизировано, но анализ его данных остается сложной задачей. Генетическая масс-спектрометрия в этом контексте позиционируется как «высокопроизводительная ПЦР». Этот метод позволяет детектировать большое количество SNP и другие вариации в одной лунке с помощью масс-спектрометрии.

Китайская компания Autobio Diagnostics, с которой «ИнтерЛабСервис» сотрудничает много лет, выпустила масс-спектрометр Autof ms. Изначально предполагалось, что он будет применяться исключительно в микробиологии, но дизайн кастомных наборов позволяет значительно расширить возможные применения прибора.

Наконец, были представлены амплификаторы от китайской фирмы Molarray. В линейке из пяти приборов — амплификаторы с термоблоками на различное количество образцов. Все приборы из линейки могут быть использованы для ПЦР в реальном времени и имеют пять каналов. При этом высокая точность детекции в амплификаторах достигается за счет того, что оптика находится не в крышке, а расположена в каждой лунке сбоку. Гибкость прибора могут обеспечить независимые температурные модули, позволяющие проводить одновременно несколько реакций ПЦР при разных условиях.

Реклама. Рекламодатель ООО «Интерлабсервис» ИНН 7720263905