Открытый диалог науки и производства состоялся на OpenBio

Участники круглого стола «Российские разработки для инженерной биологии, биобезопасности и генетических исследований» рассказали о создании отечественных приборов. Сергей Долгушин («Айвок») представил линейку товаров своей компании. В нее входят миниатюрные амплификаторы, а также прибор для мультиплексного иммуноанализа, который пока не нашел своей ниши на российском рынке. Он и его коллега Максим Зелди рассказали об источниках инвестирования для российских биотехнологических стартапов. В основном инвестиции приходят от Минобрнауки и Фонда содействиям инновациям, однако эти источники накладывают определенные ограничения. Например, нельзя получить несколько грантов одновременно, чтобы вести разработки параллельно по нескольким направлениям. Можно также рассматривать Фонд развития промышленности, однако до сих пор он не инвестировал в биотех и выставляет жесткие требования по выручке. Еще один вариант — частные инвестиции, однако надо учитывать, что при наличии одного инвестора будет сложно привлечь других —инвесторы плохо уживаются в одном проекте. Кроме того, инвесторам свойственны страхи, например, связанные с возможной утечкой из стартапа технологий вместе с уходом ключевых сотрудников.

Долгушин и Зелди перечислили факторы, сдерживающие рост биотехнологического рынка. Это регуляторные, временны́е и финансовые барьеры на вход новых компаний в этот рынок; большая доля государственных компаний среди потенциальных потребителей; отсутствие роста рынка. Спикеры назвали и факторы роста: замещение импортных приборов отечественными разработками с уникальными свойствами и надежда на уменьшение барьеров.

После компании «Айвок» выступил Антон Букатин (Институт аналитического приборостроения РАН). Он начал с обзора рынка генетических исследований. Половину рынка занимает секвенирование, следующее по объему направление — ПЦР-тесты, за ними идут синтез нуклеиновых кислот и редактирование генома. Три четверти рынка принадлежат США и лишь 1% — России. Однако, по мнению Букатина, у российского рынка огромный потенциал, так как генетические исследования широко применяются. Приборы для ПЦР импортозамещены относительно неплохо, этим занимаются пять отечественных компаний. Однако на российском рынке секвенирования представлены в основном европейские и американские компании. Институт аналитического приборостроения решает эту проблему — он занимается разработкой амплификаторов и секвенаторов в партнерстве с биотехнологическими компаниями и другими научными центрами, в том числе с Институтом системно-стратегического анализа, МГТУ им. Баумана, ФИЦ информационно-аналитических технологий и СПбАУ РАН. В частности, Букатин подробно осветил особенности приборов, созданных для компании «Синтол», и рассказал о планах по созданию секвенатора третьего поколения, работающего по принципу оптического молекулярного секвенирования. (Во время завершающей круглый стол дискуссии Сергей Долгушин также упомянул будущий прибор для секвенирования третьего поколения, только в случае «Айвок» это должен быть нанопоровый секвенатор.)

Институт также разрабатывает микрофлюидные лаборатории на чипе, планирует выпуск китов для разработчиков и готовит обучающие материалы, чтобы решить проблему дефицита инженерно-конструкторских кадров. Помимо дефицита кадров Букатин назвал и другие проблемы биотеха: использование публикаций в качестве основного KPI, поступление финансирования преимущественно из госфондов, сложный переход от НИР к НИОКР — Букатин отметил, что зачастую команды не могут выполнить требования НИОКР и останавливают разработку на стадии НИР. Кроме того, биотехнологические разработки требуют мультидисциплинарной команды. Подводя итог, Букатин сказал о необходимости реформирования принципов управления российской наукой. (Междисциплинарнось и потребность в переменах отмечали все участники круглых столов по импортозамещению.) Отвечая на вопросы из зала, Букатин заметил, что после ухода некоторых западных компаний с российского рынка взаимозаменяемость реактивов была обеспечена довольно быстро, но маловероятно, что достижима взаимозаменяемость приборных модулей и ремонт существующих в России импортных машин.

Сергей Карулин («Кортекс») рассмотрел проблему недостаточного финансирования. По его словам, Россия отстает от мира: мир уже прошел стадию инвестиций в IT и активно вкладывается в биотех, тогда как в Россия дошла только до IT. В настоящее время информационные технологии являются самой поддерживаемой и защищаемой областью. При этом большая часть продаж — это B2G (бизнес государству). Вместе с тем любая компания сейчас — это IT-компания, и биотеха это тоже касается. Например, необходимо создавать ПО для обработки данных секвенирования и облака для их хранения. Однако аутсорсинг — плохое решение. Компания должна иметь собственную IT-команду, чтобы разработчики оборудования и ПО могли работать в тесной связке.

Карулин представил обзор потенциально доступных для России зарубежных рынков. Среди них Кения и Нигерия, которые считаются новым экономическим чудом Африки, Вьетнам, Малайзия и Индонезия. Китай неохотно покупает российские продукты, предпочитая покупать российские компании. Во время дискуссии после доклада Сергей Карулин поделился опытом открытия филиала российской компании за рубежом. Он отметил, что мало просто вложить деньги, необходимо лично присутствовать в стране хотя бы год, чтобы страна привыкла к новому участнику рынка.

Елена Фадеева (Фонд «Сколково») рассказала о программе поддержки стартапов, основанной на финансировании не компании-разработчика, а возмещении затрат бизнес-ангелов. Грант покрывает бо́льшую часть затрат на внедрение нового решения. Проект предполагает трехстороннее взаимодействие между заказчиком, разработчиком и фондом, фонд в этом взаимодействии выступает в роли оператора. Участником программы может стать не только резидент «Сколково», но Фадеева отметила, что стать резидентом довольно просто.

Обзор отечественных приборов для молекулярно-генетических исследований сделал Яков Алексеев («Синтол»). Так, все этапы ПЦР-анализа можно провести на Российском оборудовании. На рынке присутствуют автоматические станции для выделения нуклеиновых кислот на магнитных частицах, амплификаторы, а также вспомогательное оборудование: термостаты, центрифуги, штативы, дозаторы и так далее. Есть также секвенаторы и синтезаторы ДНК и РНК, линейка ламинарных систем для всех уровней опасности исследований, системы подготовки воды, стерилизаторы, весы, но по-прежнему остается много приборов, аналогов которых нет в России. Сама компания «Синтол» разрабатывает решения для секвенирования по Сэнгеру и NGS.

Отвечая на вопрос корреспондента PCR.NEWS о том, существует ли сейчас для российских стартапов опасность оттока ключевых сотрудников и технологий, Сергей Долгушин сказал, что его компании ничего не угрожает. Яков Алексеев отметил, что «Синтол» имеет гособоронзаказ, поэтому его сотрудники защищены. Кроме того, он напомнил, что вскоре после объявления мобилизации Совет молодых ученых РАН подготовил обращение к президенту РАН и министру науки и высшего образования РФ с просьбой о бронировании для аспирантов и сотрудников научных институтов, а 28 сентября 2022 г. председатель комитета Государственной думы по науке и высшему образованию Сергей Кабышев пообещал, что в ближайшее время будут опубликованы акты, освобождающие вышеназванные группы от частичной мобилизации. Яков Алексеев также призвал учить историю: по его мнению, эмигрировавшие российские ученые, пытавшиеся продать себя и свои технологии за рубежом, использовались в качестве источника информации и после оказывались не нужны. Сергей Карулин добавил, что для IT-компаний релокация кадров не является проблемой, так как возможно удаленное сотрудничество. Некоторые проблемы возникают в связи с отъездом биоинформатиков из страны, но она связана не с оттоком компетенций — компетенции, рассчитанные на Россию, сложно продать в другой стране, а с возникающим дефицитом человеческих ресурсов.

Credit: Никита Дюганов | Пресс-центр OpenBio

Круглый стол «Реактивы для lifescience: заменить нельзя масштабировать» открылся докладом Владимира Науменко (ИЦИГ СО РАН) об актуальных проблемах нейробиологии в России на примере своей лаборатории, которая изучает генетическими основы поведения на животных. Лаборатория использует методы ПЦР и секенирования, для которых нужны реактивы, пластик и оборудование. С импортозамещением реактивов, особенно для ПЦР, все в порядке. Российский пластик — эппендорфы, носики, планшеты и т. д. — тоже неплох, но есть проблемы с культуральным пластиком. Самое незащищенное место в настоящее время — это вестерн-блоттинг. В России недостаточно широкий ассортимент антител, не производятся мембраны для переноса белка. Антитела можно достать, несмотря на логистические затруднения. Мембраны пока достать негде — Китай их также не производит. Оборудование частично замещено российским, но многого не хватает, например, микроскопических систем.

Во время обсуждения доклада поднялась проблема смены реактива: исследования для публикации в высокоцитируемом журнале могут занимать до восьми лет, и все это время эксперименты желательно проводить с одними и теми же реактивами. Замена одной марки на другую может плохо сказаться на стабильности результатов.

Следующий спикер Евгений Денисов (НИИ онкологии Томского НИМЦ) также поделился взглядом изнутри лаборатории. Лаборатория Денисова образовалась относительно недавно, однако она уже стала центром single cell компетенций. В лаборатории выполняется NGS-анализ на приборах Illumina и GeneMind. Денисов сделал обзор рынка высокопроизводительного секвенирования, отметив пока малоизвестные в России фирмы Element Biosciences и Singular Genomics. По словам Денисова, эти приборы дешевле и лучше, чем Illumina, а сроки поставок из Китая вполне приемлемы. Весной этого года реагенты Illumina пропали с российского рынка, потом вернулись, но по сильно возросшей цене. Секвенаторы MGI лабораторию не устраивают из-за низкой конверсии.

Среди проблем медицинского NGS спикер назвал почти полное отсутствие наборов для диагностики, получивших РУ. Еще одна проблема — отсутствие отечественных зондов для гибридизационного NGS-анализа. Лаборатория Денисова в коллаборации с другими командами к настоящее время разрабатывает гибридизационную панель и планирует довести разработку до внедрения в клинику.

После Денисова выступила специальный гость круглого стола Анна Тевяшова (Минобрнауки РФ). Она рассказала о проекте Минобрнауки «Новая медицина». Цель проекта — создание новых лабораторий для разработки лекарственных средств и медизделий, а также борьба с антимикробной резистентностью.

Был объявлен конкурс среди молодых биотехнологических лабораторий, имеющих индустриального партнера. Победителям должно быть назначено финансирование на три года в размере 16,9 млн. рублей в год. В конкурсе могли принять участие проекты, отвечающие следующим требованиям:

·         ориентированность на практически важный результат и одобрение со стороны представителя реального сектора экономики;

·         лаборатория должна быть новым структурным подразделением;

·         команда должна быть готова привлекать внебюджетные средства.

Все заявки должны были регистрироваться в электронной системе.

Было подано 300 заявок. Предварительный отбор прошли 120 заявок, дальше они были переданы на рассмотрение в РАН. Окончательный отбор пройдут только те заявки, которые получат положительное решение РАН. К настоящему времени 19 из 120 заявок получили первое отрицательное заключение академии наук.

Процесс работы с заявками выявил ряд особенностей. Так, критерии предварительного отбора из требований превратились в рекомендации. Бо́льший отклик дали производители фармацевтических субстанций по сравнению с производителями реактивов. РАН на этапе окончательного отбора отдает преимущество более фундаментальным проектам по сравнению с прикладными. Кроме того, условия по источникам финансирования ставят вопрос об интеллектуальной собственности, решения для которого пока нет.

После доклада Тевяшвой завязалась оживленная дискуссия. Антон Букатин выступил как представитель лаборатории, которая подавала заявку на конкурс. По его словам, заявка отвечала входным требованиям и была подана вовремя, однако электронная система дала сбой. Связаться с человеком, ответственным за проект, не удалось. Организаторы вышли на связь только после закрытия приема заявок и дали дополнительное время на регистрацию в электронной системе, однако дальнейшая судьба заявки неизвестна. Анна Тевяшова ответила, что Минобнауки планирует дополнительный конкурс для лабораторий, не успевших подать заявку в срок или не прошедших отбор РАН.

Представители лабораторий и компаний отмечали плохую организацию информационной кампании. Информация о конкурсе передавалась из уст в уста, а некоторые из присутствующих впервые услышали о нем на круглом столе. Много вопросов вызвало привлечение академиков в качестве экспертов по прикладным биотехнологическим проектам. Производители реактивов заметили, что они бы дали отклик на конкурс, но информация о нем была направлена только на ученых, и высказали пожелание о взаимодействии Минобрнауки с компаниями.

Credit: Никита Дюганов | Пресс-центр OpenBio

Яков Алексеев («Синтол») представил обзор российского рынка реактивов. Он отметил, что пандемия COVID-19 создала на внутреннем рынке конкуренцию компаний, производящих реактивы для ПЦР. Локализованы и масштабированы производства продуктов для всех этапов ПЦР-анализа. Возникали как ПЦР-тест-системы, так и наборы для определения штаммов методом секвенирования. Кроме того, набрала популярность изотермическая амплификация. Яков Алексеев также рассказал о ситуации на российском рынке реагентов для секвенирования. Он сказал, что девиз круглого стола нужно поменять на «Заменить нужно масштабировать» и пригласил компании и лаборатории к сотрудничеству.

Отвечая на вопросы из зала, спикер отметил, что NGS востребовано в российской медицине, но объяснил, что лаборатории в основном пользуются in house наборами, имеющими статус RUO, а врачи используют результаты исследований в качестве вспомогательной информации.

После Алексеева выступил Вадим Кумейко (ДВФУ, Владивосток). Он представлял Центр геномной и регенеративной медицины, который осуществляет полный цикл работы с биоматериалами: забор образцов (в основном опухолевых), биобанкирование, анализ, скрининг лекарств, взаимодействие с врачами. Вместе с санкциями у Центра возникло довольно много проблем. В России нет импортозамещения для масс-спектрометрии, высокотехнологичной микроскопии и вестерн-блоттинга. В дискуссии участники круглого стола заметили, что в России есть производитель микроскопов, но Кумейко объяснил, что Центр использует атомно-силовую микроскопию в реальном времени. Микроскопические системы должны обладать определенными параметрами и, самое главное, особыми зондами, которые не вязнут в тканях.

Кумейко также рассказал, что фармкомпании, которые прежде работали на импортных опухолевых клеточных линиях, стали заказывать лабораториям создание новых отечественных линий. Однако прервались и поставки импортных сред. Потребность в импортозамещении сред для культивирования клеток очень высока.

Лаборатория Григория Степанова (ИХБФМ СО РАН, г. Новосибирск) занимается регуляцией генной экспрессии с помощью редактирования генома. Один из инструментов исследований — система CRISPR/Cas9. Лаборатории требовалось большое количество фермента Cas9, и его производство было налажено в партнерстве с компаниями «Биосан» и «Биолабмикс». Кроме того, была разработана биохимическая платформа для синтеза мРНК. Сейчас идет наладка синтеза функциональных искусственных РНК.

Следующим выступил представитель клинической лаборатории — Вячеслав Романов (клиника «Санитас»). Для клинических лабораторий импортозамещение реагентов создает проблему поддержания качества. Решить эту проблему может испытательная лаборатория, в которой будут тестироваться реагенты различных фирм и приводиться к единому стандарту протоколы. Этот процесс подстегнет производителей и поспособствует улучшению качества продукции. Такая лаборатория, причем автоматизированная, организована на базе клиники «Санитас».

В качестве примера работы лаборатории Вячеслав Романов рассказал об оптимизации протокола анализа на гельминтозы с помощью зарегистрированного ПЦР-набора «Гельмо-скрин». В изначальном виде протокол не работал, в частности, не выявлял яйца описторхов. После ряда экспериментов сотрудники лаборатории выяснили, что пробоподготовка обязательно должна включать этап разрушения яиц паразитов. Кроме этого лаборатория протестировала с этим набором несколько полимераз. Одна из них работала совсем плохо. Лаборатория направила информацию производителю, но производитель не увидел необходимости поднимать качество — полимераза продается и так.

Романов отметил, что в России широко распространен лямблиоз. Лямблии живут в водопроводной воде Новосибирска, Омска, Томска и других городов, но, по мнению спикера, Роспотребнадзор не уделяет этому достаточно внимания.

В финале выступления Вячеслав Романов коснулся проблемы использования незарегистрированных продуктов. В настоящее время это возможно, но нет четких регуляторных алгоритмов, чаще всего это делается «по знакомству».

Виталий Огинский (SkyGen) рассказал о проекте по созданию ассоциации специалистов в области молекулярной, клеточной и синтетической биологии. Предполагается, что ассоциация объединит вузы и лаборатории, позволит обмениваться реактивами и приборной базой. Она будет общедоступной площадкой для дискуссии и позволит в том числе делиться впечатлениями от продукции разных производителей. По задумке на этой же площадке будут представлены компании, причем не в формате конкуренции: не секрет, что у каждой компании есть самый успешный продукт; представленность всех компаний на одной площадке обеспечит их взаимодополняемость, пользователи смогут собирать оптимальные для конкретных исследований наборы реагентов и оборудования.

На круглом столе также выступили Кристина Разум («Диаэм») и Илья Киров (ВНИИСБ). Кристина Разум рассказала о прежних и новых производителях реагентов и оборудования, доступных сейчас на российском рынке, Илья Киров — об исследовании мобилома растений методом CANS. Метод требует нуклеазы Cas9, которая уже производится в России, и нанопорового секвенирования, которое невозможно импортозаместить. Наладка поставок товаров Oxford Nanopore Technologies заняла некоторое время, но, по словам Огинского, ячейки для нанопорового секвенирования поступят на российский рынок к декабрю.

Руководитель OpenBio-2022 Юлия Линюшина завершила работу круглых столов, отметив, что по их итогам будет сформирована резолюция, которую направят губернатору Новосибирской области.

Credit: Никита Дюганов | Пресс-центр OpenBio

Отраслевой комплекс мероприятий OpenBio-2022 состоялся в наукограде Кольцово Новосибирской области 27–30 сентября.

Отраслевой комплекс мероприятий OpenBio-2022 стартовал в Кольцово

Второй день OpenBio-2022: как сделать голубой ячмень и оранжевые дрожжи

Credit: Никита Дюганов | Пресс-центр OpenBio

Информация о спикерах:

Сергей Долгушин, руководитель компании «Айвок», г. Зеленоград.

Максим Зелди, директор по развитию компании «Айвок», г. Зеленоград.

Антон Букатин, к.ф.-м.н., зам. директора по научной работе Института аналитического приборостроения РАН, г. Санкт-Петербург.

Сергей Карулин, генеральный директор и соучредитель IT-компании «Кортекс», г. Краснодар.

Елена Фадеева, проектный менеджер Кластера биологических и медицинских технологий, Фонд «Сколково», г. Москва.

Яков Алексеев, директор по науке и сооснователь компании «Синтол», г. Москва.

Владимир Науменко, д.б.н., зав. лаб. нейрогеномики поведения ИЦИГ СО РАН, г. Новосибирск.

Евгений Денисов, к.б.н., зав. лаб. биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Томского НИМЦ, г. Томск.

Анна Тевяшова, заместитель директора Департамента координации деятельности научных организаций Минобрнауки РФ, г. Москва.

Вадим Кумейко, зам. директора Института наук о жизни и биомедицины Дальневосточного федерального университета, г. Владивосток.

Григорий Степанов, зав. лабораторией геномного редактирования ИБХФМ СО РАН, г. Новосибирск.

Вячеслав Романов, к. м. н., зав. ПЦР-лабораторией клиники «Санитас».

Виталий Огинский, генеральный директор компании SkyGen, г. Москва.

Кристина Разум, к. б. н., руководитель обособленного подразделения ООО «Диаэм», г. Москва.

Илья Киров, к. б. н., старший научный сотрудник ФГБНУ ВНИИСБ, г. Москва.