Коротко

Ученые из США разработали вычислительный алгоритм для неинвазивного скрининга эмбрионов, полученных с помощью вспомогательных репродуктивных технологий, на анеуплоидии. Они исходили из предположения, что различия между анеуплоидными и эуплоидными эмбрионами отразятся на их морфологии и морфокинетике, а значит, можно разработать модель на основе микроскопических изображений и клинических данных эмбрионов.

Алгоритм получил название STORK-A. Для его создания использовались статичные изображения 10 378 эмбрионов с известной плоидностью от 1 385 американских пациентов. STORK-A отличал анеуплоиные эмбрионы от нормальных с точностью 69,3%, а комплексную анеуплоидию от нормальной плоидности — с точностью 77,6%. На независимом наборе данных из испанской клиники алгоритм сработал примерно с такой же точностью. По мнению ученых, в будущем STORK-A может стать дополнением к стандартным методам оценки качества эмбрионов. Рекомендации о преимплантационном генетическом тестировании можно будет давать на основе результатов первичного неинвазивного анализа.

Работа опубликована в The Lancet Digital Health.

Американский колледж медицинской генетики и геномики (ACMG) настоятельно рекомендует для всех беременных неинвазивный пренатальный скрининг (НИПС) — анализ внеклеточной ДНК плода в крови матери — как имеющий преимущество по сравнению с другими подходами для выявления распространенных трисомий. Новые практические рекомендации ACMG опубликованы 16 декабря.

В 2016 году ACMG рекомендовала информировать беременных пациенток о том, что НИПС доступен и обладает большей чувствительностью при выявлении трисомий по хромосомам 21, 18 и 13, чем традиционные биохимические и ультразвуковые методы скрининга. Теперь на основании данных обзора, опубликованного в мае (подробнее на PCR.NEWS), ACMG рекомендует проводить НИПС для трисомий 21, 18 и 13 как при одноплодной, так и при двуплодной беременности, а также предлагать пациенткам НИПС для выявления анеуплоидий половых хромосом плода при одноплодной беременности. Данные подтверждают высокую точность и низкий уровень ложноположительных результатов НИПС.

Команда проекта REMAP-CAP опубликовала в JAMA результаты анализа 180-дневной смертности у взрослых пациентов с COVID-19, госпитализированных в отделение интенсивной терапии в критическом состоянии. Исследование охватило 4 869 человек. Оно началось в марте 2020 года. Наблюдение за пациентами завершилось в марте 2022года.

Участники были случайным образом распределены по группам в зависимости от схемы лечения. Тестировались иммуномодуляторы, реконвалесцентная плазма, антиагреганты, антикоагулянты, противовирусные препараты и кортикостероиды. Данные о выживаемости через 180 дней от начала болезни были доступны для 4 107 пациентов; в рассматриваемый период умерли 1 517 (36,9%) из них. По результатам статистического анализа, выживаемость улучшали антагонисты рецептора провоспалительного интерлейкина 6 и антиагрегантные препараты. Антикоагулянты и реконвалесцентная плазма были скорее бесполезны, а противомалярийные препараты и их комбинация с лопинавиром/ритонавиром с высокой вероятностью причиняли вред.

Авторы редакционного материала, посвященного исследованию, отмечают, что его результаты не могут повлиять на существующие рекомендации по лечению COVID-19 по нескольким причинам. Например, антиагрегантная терапия ранее была связана с риском кровотечений у пациентов в критическом состоянии. Кроме того, с 2020 г. клиника COVID-19 изменилась — инфекция реже прогрессирует до тяжелой благодаря коллективному иммунитету и, предположительно, сниженной заразности омикрона для клеток легких. Тем не менее, полученные данные имеют определенную ценность, так как коронавирусная инфекция останется причиной критических состояний во всем мире.

На прошлой неделе американская компания Avidity Biosciences представила результаты фазы 1/2 КИ препарата AOC 1001 против миотонической дистрофии 1 типа. Это заболевание развивается из-за экспансии CTG-повторов в 3'-нетранслируемом участке гена миотонин-протеинкиназы DMPK и связанным с ними нарушением регуляции сплайсинга. Препарат представляет собой конъюгат моноклонального антитела к рецептору трансферрина 1 и малой интерферирующей РНК, нацеленной на патогенную мРНК DMPK. Компания утверждает, что такой дизайн конъюгата позволяет доставлять терапевтическую миРНК таргетно в мышечную ткань.

В испытаниях безопасности и переносимости приняли участие 38 пациентов; ключевые биомаркеры оценили у 19. Участники получили AOC 1001 однократно в дозировке 1 мг/кг, двукратно в дозировке 2 мг/кг или плацебо. Согласно результатам предварительного анализа, у всех пациентов, получивших препарат, снизился уровень DMPK. Для участников группы большей дозировки показано улучшение сплайсинга 31% ключевых генов, специфичных для мышц. У некоторых пациентов наблюдались ранние признаки клинического улучшения. Большинство побочных эффектов были легкими и умеренными.

Представители Avidity называют успешную доставку терапевтической РНК в мышечную ткань человека главным прорывом испытаний.

В сентябре 2022 года из-за тяжелого побочного эффекта у пациента, получившего AOC 1001 в дозировке 4 мг/кг, по решению FDA был приостановлен набор в испытания новых участников. Компания работает над разрешением этой ситуации. Пациенты из групп препарата и плацебо, которые уже участвуют в проекте, перейдут на следующий его этап.

Ученые из США проверили, что лучше защищает людей — вакцинация против COVID-19 или естественный иммунитет, приобретенный в результате болезни. Авторы оценивали смертность, госпитализацию и обращение в отделения скорой помощи по любым причинам, включая COVID-19. Смертность и частота госпитализаций были на 37% ниже среди вакцинированных, чем среди переболевших. Особенно заметно смертность снижалась у людей 60 лет и старше. Вакцинированные также на 24% реже обращались в отделения скорой помощи.

В работе была проанализирована медицинская информация жителей штата Индиана (США); всего было отобрано 267 847 пар человек, совпадавших по полу, возрасту и факторам риска. Анализ показал, что привитые люди заболевали COVID-19 чаще (6,7%), чем переболевшие (2,9%), но при этом болели не так тяжело. Авторы призывают людей вакцинироваться даже в тех случаях, когда они уже перенесли COVID-19.

Бесполое размножение — частое явление у таких животных, как морские звезды или палочники, однако среди позвоночных это редкость. Долгое время считалось, что партеногенез — своего рода последний шанс на размножение, когда особи противоположного пола отсутствуют. Однако не так давно в аквариуме Шедда в Чикаго зебровая акула произвела потомство путем партеногенеза, несмотря на то, что рядом присутствовали здоровые самцы. Авторы статьи в Journal of Fish Biology говорят о том, что лучшее понимание таких процессов важно для сохранения популяций акул в аквариумах и в дикой природе.

Ученые тестируют геномы всех акул, рожденных в аквариуме Шедда с 2004 года. В 2008 году появилась новая кладка. После того, как акулы вылупились, их тоже протестировали. К удивлению ученых, анализ показал, что акулы появились на свет путем партеногенеза. К сожалению, животные прожили всего несколько месяцев, как нередко бывает в таких случаях, вероятно, из-за редких рецессивных генетических состояний. Но по словам авторов, то, что они вообще родились, меняет представление биологов о половом и бесполом размножении.

Китайские ученые определили структуру ДНК-полимеразы вируса оспы обезьян. Она состоит из апофермента — полимеразы F8 и двух кофакторов. С помощью криоэлектронной микроскопии ученые проанализировали архитектуру комплекса ДНК-полимеразы с молекулой ДНК. Оказалось, что фермент относится к так называемым белкам скользящего зажима, которые окружают ДНК в области репликационной вилки и продвигаются вперед. Характер связывания полимеразы вируса оспы обезьян схож с таковым для ДНК-полимераз семейства B. По мнению ученых, полученные данные могут быть полезны для разработки противовирусных препаратов. Работа опубликована в Science.

Издательство PLOS отметило почти 50 статей ученого Дидье Рауля как потенциально не соответствующие требованиям по этике для исследований на людях. Рауль стал противоречивой фигурой в науке после его работ, показавших эффективность гидроксихлорохина или хлорохина при COVID-19. Дальнейшие исследований продемонстрировали, что эти препараты в комбинации с антибиотиком и без него не только не помогают при коронавирусной инфекции, но и могут повысить смертность.

Этим летом Рауль ушел с поста директора больницы Университета инфекционных заболеваний в Марселе после инспекции Французского национального агентства по безопасности лекарственных средств и изделий медицинского назначения (ANSM), которое выявило «серьезные недостатки и несоответствия регуляциям для исследований на людях». ANSM наложило санкции на больницу и призвало начать уголовное расследование.

Вслед за сообщениями о нарушениях, поступивших из нескольких источников, издательство PLOS рассмотрело 108 статей; соавтором многих из них был Рауль. Расследование показало, что несколько номеров, присваиваемых комиссией по этике, используются во многих статьях. Более того, у этих статей были и другие «красные флаги» — очень плодовитые авторы (им пришлось бы писать со скоростью почти одну статью в три дня), а также нераскрытые связи с фармацевтическими компаниями. Расследование продлится, по оценкам издателя, по крайней мере еще год. Статьи появлялись в журналах PLOS ONE, PLOS Neglected Tropical Diseases, PLOS Genetics и PLOS Pathogens.

Американские исследователи проанализировали медицинские записи 194 191 человека в базе данных Kaiser Permanente, калифорнийской компании, оказывающей услуги медицинского страхования. У всех COVID-19 диагностировали с января 2020 года по май 2021 года, до начала повсеместной вакцинации. Анализ показал, что у людей, чаще занимающихся физическими упражнениями, были ниже риски госпитализации и смерти в течение 90 дней после диагноза COVID-19.

Людей разделили на пять категорий — от тех, кто занимался спортом менее 10 минут в неделю, до тех, кто занимался спортом более 150 минут в неделю. Связь между физической активностью и более низкими рисками госпитализации и смерти сохранялась для людей с такими хроническими состояниями, как повышенное давление, сердечно-сосудистые заболевания и ожирение. По мнению авторов, самое важное, что люди могут сделать для предотвращения неблагоприятного исхода при коронавирусной инфекции — это вакцинироваться и больше двигаться.

Чешские ученые проверили связь 105 биологических, социально-экономических, поведенческих факторов и факторов окружающей среды с риском заражения SARS-CoV-2 и тяжелым течением COVID-19. Работа проводилась во время четвертой волны. Участниками исследования стали пользователи сети Интернет. Ученые воспользовались методом снежного кома: первый опросник они запустили в соцсети. Кроме вопросов по предмету он содержал кнопку «поделиться». Опрос проводился анонимно, но пользователи по желанию могли оставить адрес электронной почты, чтобы участвовать во втором этапе исследования. Ссылку на второй опросник отправляли на эти адреса. Итоговый набор данных включал анкеты 5 164 изначально коронавирус-отрицательных респондентов, 709 из которых заразились SARS-CoV-2.

По результатам статистического анализа 13 факторов были связаны с повышенным риском инфекции, в том числе мужской пол и бо́льший размер домохозяйства, 16 — со сниженным риском, среди них ношение масок и употребление напитка из ройбуша. Удивительно, но ношение масок также было связано с более тяжелым протеканием COVID-19. Авторы объясняют это тем, что люди, предрасположенные к тяжелой инфекции из-за сопутствующих заболеваний или других обстоятельств, тщательнее соблюдают меры предосторожности. Если же они заражаются, болезнь действительно протекает тяжело.

Работа опубликована в Biology Methods and Protocols.