Коротко

Во второй день научно-практической конференции «Клиническая диагностика и персонализированная медицина» проходит секция «Персонализированная медицина: клинические случаи и технологии».

Секцию открыл доклад Глеба Бронина, к. м. н., доцента, зав. отделением трансплантации костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток ГБУЗ «Морозовская ДГКБ ДЗМ», о трансплантации фекальной микробиоты для коррекции состояния пациентов, получивших аллогенные ГСК. Для раннего посттрансплантационного периода одним из характерных осложнений является реакция «трансплантат против хозяина» (РТПХ). Кишечная форма реакции может привести к тяжелым последствиям вплоть до летального исхода. В ее развитии участвуют не только клетки донора и реципиента, но и кишечные бактерии. При этом основным драйвером служат не патогены, пришедшие извне (во время и после ТГСК соблюдается строгая стерильность), а оппортунисты в составе нормальной микрофлоры.

Одной из новейших стратегий профилактики РТПХ считается реконтаминация кишечника с помощью трансплантации фекальной микробиоты (ТФМ). Бронин представил первые результаты исследования профилактики и терапии с помощью ТФМ желудочно-кишечных осложнений у пациентов в возрасте 3–18 лет после алло-ТГСК. Работа началась в июне 2022 года и выполняется совместно с ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА. ТФМ использовалась при отсутствии ответа на стероиды, на противомикробные препараты или же для подготовки к трансплантации при наличии резистентных микробов в кишечнике. Было выполнено семь процедур для пяти пациентов, у четырех из них был достигнут клинический эффект. ТФМ значительно улучшала их состояние, ускоряла выписку и позволяла отменить противовоспалительные препараты. Нежелательные явления также отмечались, например, у всех пациентов наблюдались тошнота и метеоризм, но все они были временными. По мнению докладчика, ТФМ — перспективный метод терапии тяжелых желудочно-кишечных осложнений после алло-ТГСК.

На секции обсуждались новейшие научные разработки в области диагностики «на чипах» и пути их адаптации для использования в местах оказания медицинской помощи. К.ф.м.н. Дмитрий Багров (биологический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова) рассказал о перспективах применения электроформованных мембран в биосенсорах. Мембраны, сформированные из ультратонких полимерных волокон методом электроспиннинга, можно использовать как подложки в планшетах или микрофлюидных устройствах или для повышения пределов обнаружения аналита за счет фильтрации.

К.ф.м.н. Дмитрий Нечипуренко (физический факультет МГУ) представил концепцию простого микрофлюидного устройства для простой оценки гемостаза (свертываемости крови): каналы на чипе пересекают полоску коллагена, на которой образуются тромбоподобные структуры.

Татьяна Ведехина (ФНКЦ физико-химической биологии ФХМ ФМБА России) рассказала о белковых микрочипах, несущих белки коронавируса SARS-CoV-2, для профилирования антительного ответа. Перспективными себя показали нуклеокапсидный белок и рецептор-связывающий домен S-белка; авторы получили интересные результаты как для переболевших коронавирусной инфекцией, так и для привитых российскими вакцинами «Спутник V» и «Ковивак».

Заключительный доклад д.ф.м.н. Андрея Сарычева, главного научного сотрудника ФГБУ Института теоретической и прикладной электродинамики РАН, был посвящен детекции белков и вирусов методом гигантского комбинационного рассеяния (Surface-enhanced Raman spectroscopy, SERS). Усиление комбинационного рассеяния молекул, адсорбированных на металлических наноструктурированных поверхностях, настолько значительно, что позволяет обнаруживать единичные молекулы.

Начала работу научно-практическая конференция «Клиническая диагностика и персонализированная медицина», организованная ФГБУ ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России. Конференция проходит в Одинцово, в отеле Park Inn, только в очном формате, без онлайн-трансляции. Для разработки и внедрения в клиническую практику новых технологий диагностики необходимо тесное взаимодействие сотрудничество разработчиков, научных сотрудников и клиницистов, и в организации такого взаимодействия конференции играют неоценимую роль.

На пленарном заседании выступил Владимир Баклаушев, зам. генерального директора по научной работе ФГБУ ФНКЦ ФМБА России, главный внештатный специалист по клинической лабораторной диагностике ФМБА. Его доклад был посвящен регенеративной терапии неврологических заболеваний – это передний край персонализированной медицины. «Человек – венец эволюции, но на пути к вершине эволюции он много утратил, а именно способность к регенерации», — так начинался доклад. Рыбка данио или аксолотль могут регенерировать треть или даже половину сетчатки, восстанавливать рассеченный спинной мозг, а для человека это пока недостижимо. Нейрональные стволовые клетки у взрослого человека (даже если они существуют) не могут обеспечить регенерацию, при этом по ремоделированию клеточного матрикса и репрограммированию клеток получены впечатляющие результаты, в том числе на млекопитающих.

Директор ФГБУН Института аналитического приборостроения РАН Анатолий Евстрапов рассказал о микрофлюидных технологиях в биотехнологических приборах, о современных требованиях к диагностике point-of-care и lab-on-a-chip и о реалистичных сроках разработки (не менее 3–5 лет), о технологиях работы с пластиком, 3D-печати и использовании смартфонов для считывания и передачи данных. В США выживают 75% стартапов по микрофлюидике, тогда как в России, по-видимому, около 10%, отметил докладчик.

В районе Калькутты, второго по площади и четвертого по численности населения города Индии, распространены многие бактерии, вирусы и паразиты, вызывающие диарею. Однако симптомы появляются только в тех случаях, когда патогенных микроорганизмов в ЖКТ достаточно много. Если их мало, инфекция может быть субклинической, то есть протекать без выраженных симптомов.

Авторы статьи в Scientific Reports исследовали стул 23 пациентов из Калькутте, у которых был обнаружен Vibrio cholerae O1с помощью культивирования. Они провели метагеномный анализ, который точнее, чем культивирование, определяет численное соотношение патогенов, проверили образцы на наличие гена, кодирующего субъединицу А холерного токсина (ctxA) и определили содержание холерного токсина. Два образца не дали положительных результатов ни в одном из тестов; при этом метагеномный анализ выявил в них гены Streptococcus pneumoniae и Salmonella enterica. таким образом, диарея у них была вызвана не холерой, а другим инфекционным агентом. (Для St. pneumoniae  такие случаи тоже описаны). После этого авторы проанализировали образцы стула 22 пациентов с диареей, у которых холерный вибрион не был культивирован, и у трех из них обнаружили гены V. cholerae. Это означает, что в Калькутте происходят субклинические инфекции, с которыми могут быть связаны случаи хронической холеры и спорадические вспышки заболевания.

На этой неделе компания Moderna обнародовала первые результаты фазы 2/3 КИ бивалентной вакцины mRNA-1273.222, нацеленной на исходный уханьский штамм SARS-CoV-2 и варианты BA.4/BA.5 штамма омикрон и введенной в качестве бустерной дозы. В испытаниях приняли участие 511 взрослых индивидов, привитых ранее по полной схеме. Они получили mRNA-1273.222 или исходную вакцину mRNA-1273 через 9,5 мес. и 4,5 мес. после первичной вакцинации, соответственно. Титры нейтрализующих антител против BA.4/BA.5 в крови испытуемых обеих групп были схожи до введения бустера. При этом mRNA-1273.222 обеспечивала бо́льший прирост таких антител по сравнению с mRNA-1273.

Ранее были опубликованы результаты испытаний бивалентного препарата mRNA-1273.214, нацеленного на уханьский штамм и вариант омикрона BA.1. Интересно, что оба обновленных бустера индуцировали образование нейтрализующих антител против нового варианта омикрона BQ.1.1, который в настоящее время активно распространяется в мире, однако уровень антител против него был ниже, чем против таргетных вариантов.

Частота побочных эффектов после mRNA-1273.222 и mRNA-1273.214 была такой же, что и для mRNA-1273, или ниже. Moderna представит данные о безопасности и иммуногенности бивалентных бустеров регуляторам и подготовит для публикации.

Ранее компания получила разрешение FDA на экстренное использование mRNA-1273.222.

Карантинные меры против COVID-19 сдерживали распространение сезонных респираторных заболеваний. Число инфекций вирусом гриппа и респираторно-синцитиальным вирусом (РСВ) резко снизились в 2020 году и начале 2021 года. Теперь в Северном полушарии число случаев РСВ растет, а уровень госпитализаций по поводу гриппа в Соединенных Штатах в это время года — самый высокий с 2010 года.

Причиной может быть то, что население «более иммунологически наивно», чем до COVID-19, комментирует для Nature Скотт Хенсли, иммунолог из Пенсильванского университета в Филадельфии: теперь «у вас будут дети в возрасте трех-четырех лет, которые никогда не видели РСВ», тогда как раньше практически все контактировали с этим вирусом до двух лет. Аналогичным образом в старших группах отсутствие легких и бессимптомных инфекций, действующих как бустерные вакцины, снизило уровень антител против респираторных вирусов. В августе 2021 года исследователи во Франции ввели термин «иммунный долг» (immune debt) для описания этого снижения популяционного иммунитета. Естественно, это не означает безвозвратного повреждения иммунной системы, хотя такой миф уже появился в соцсетях; со временем популяционный иммунитет опять поднимется.

Проект Autism Speaks, посвященный изучению расстройств аутистического спектра, представил обновленную версию базы MSSNG, содержащей полные геномы людей с РАС. С момента предыдущего объявления об апдейте база расширилась более чем в два раза — теперь она вмещает 11 312 ДНК-последовательностей индивидов из семей, в которых зарегистрированы аутистические расстройства, в том числе 5 100 геномов индивидов с РАС и 6 212 геномов их родителей и сиблингов без расстройств. Ресурс содержит не только сами геномы, но и аннотированные генетические варианты, а обновленный веб-интерфейс позволяет анализировать генотипы и фенотипы. Авторы называют базу MSSNG путеводителем, который дает выход на расширенные исследования этиологии идиопатических РАС — в настоящее время такими признаются около 85% случаев расстройств.

Немецкие медики описали в Deutsches Ärzteblatt International случай оспы обезьян, который начался с пузырька в уголке рта. Пациентом был ВИЧ-положительный 51-летний мужчина без типичных клинических признаков инфекции. ВИЧ-инфекция успешно контролировалась с помощью АРТ. При первичном приеме врач назначил пациенту мазь, однако она не помогла — через несколько дней пузырек превратился в болезненную язву. На повторном приеме врач взял мазок с язвы; ПЦР-анализ мазка оказался положительным на вирус оспы обезьян. Вскоре область поражения увеличилась: язвы появились на нёбе, при этом нарастал отек основания языка и стала невнятной речь. Пациента госпитализировали и назначили ему тековиримат, после чего симптомы быстро сошли на нет. По мнению авторов статьи, этот случай подчеркивает, что на ранних этапах симптомы оспы обезьян могут быть слабо выраженными.

В октябрьском выпуске «Писем в Вавиловский журнал генетики и селекции» опубликована статья ученых из ФНЦ биоразнообразия наземной биоты ДВО РАН, посвященная популяционной генетике домашней кошки на о. Кунашир. Генетические профили были построены для 146 кошек из пгт. Южно-Курильск. Их сравнили с профилями кошек из соседних регионов. В данной работе были проанализированы образцы от 111 кошек из г. Холмск (о. Сахалин). Кроме того, для сравнения использовались опубликованные данные по кошкам с о. Хоккайдо (Япония).

Популяцию домашних кошек с о. Кунашир отличает от других российских популяций высокая доля бобтейлов (65,2%). При этом генетические профили кунаширских кошек были ближе к таковым для других прибрежных популяций Дальнего Востока РФ, чем для кошек Японии. Основываясь на полученных результатах, авторы описали факторы, определившие генетическую структуру домашних кошек Южно-Курильска. Первый — это ее относительная изолированность. Второй — двойное происхождение. Изначально на месте Южно-Курильска находился японский рыболовецкий поселок, интенсивное развитие которого происходило уже после Второй мировой войны и включения Кунашира в состав СССР. Наконец, третий фактор — разрушительное цунами 1994 г., которое привело к резкому сокращению численности кошек. Таким образом, популяцию кошек Южно-Курильска сформировали эффект основателя и последующее прохождение через бутылочное горлышко.

6–8 декабря 2022 г. в Пущино, в Институте биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН (ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН) будет проходить VIII Пущинская конференция «Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов» и Школа-конференция молодых ученых, аспирантов и студентов «Генетические технологии в микробиологии и микробное разнообразие»

Мероприятия посвящены памяти выдающегося ученого-микробиолога Льва Владимировича Калакуцкого

Программа конференций охватывает широкий спектр направлений исследований современной микробиологии, которые неразрывно связаны с рядом других областей биологической науки, с развитием и использованием генетических технологий и методов биоинформатики.

Работа конференций будет проходить по секциям:

·         Микробное разнообразие и экология микроорганизмов.

·         Биохимия, физиология и молекулярная биология микроорганизмов; генетические технологии.

·         Ресурсный биотехнологический потенциал микробного разнообразия.

Программа включает 15 пленарных и секционных докладов ведущих ученых, специалистов в области микробиологии, молекулярной биологии и генетики, биоинформатики, а также 65 докладов и постерных сообщений молодых ученых, аспирантов и студентов научных организаций и университетов из различных регионов страны.

Тезисы докладов (более 160) опубликованы в сборнике материалов (издательство ГЕОС), индексируемом в базе РИНЦ.