Биоинформатика

Горизонтальный перенос транспозонов вирусами оказался важным источником новых интронов

Эукариот «отселили» от хеймдаллархей на эволюционном древе

Модель Difface создает трехмерные реконструкции лиц по геномным данным

Курение и алкоголь влияют на мутационный ландшафт слизистой оболочки щеки

Трансмиссивные опухоли млекопитающих похищают ДНК здоровых клеток

Сборка полных геномов четырех поколений одной семьи помогла вычислить скорость накопления мутаций в человеческом геноме

Группа под руководством геобиологов из Бельгии описала новый вид кабельных бактерий — многоклеточных прокариотических организмов, способных проводить электричество на сантиметровые расстояния. Клетки кабельных бактерий имеют палочковидную форму и соединяются между собой в нити, покрытые общей внешней мембраной. Они могут переносить электрический заряд между слоями осадочных пород — это основа их метаболизма. Электроны переносятся из более глубоких слоев осадка, где бактериальные клетки осуществляют...

13-я Всероссийская научно-практическая конференция по геномному секвенированию и редактированию пройдет 21–22 мая

Стартовал первый в России курс по биоинформатике нанопорового секвенирования

Риск тяжелой формы преэклампсии можно оценить по экспрессии шести генов

Микроорганизмы доминируют в биосфере, но отследить их раннюю эволюцию проблематично из-за отсутствия окаменелостей. Однако древние отложения и горные породы могут указать на особенности метаболизма бактерий в тот или иной период. Авторы статьи в Science проанализировали их, чтобы составить карту эволюции аэробных микроорганизмов. Кислородную катастрофу, которая случилась около 2,43–2,33 млрд лет назад из-за возникновения оксигенного фотосинтеза, исследователи называют ключевым поворотным моментом...

Бактерии используют метаболизм хищных амеб для синтеза «химического оружия» против них

Эволюция со скоростью света: как ИИ помог «разогнать» фотосинтез

Любовь к музыке частично определяется генами

Мандимицин — новое природное соединение, эффективное против резистентных грибков

Компактная, но эффективная Cas9 обнаружена у стрептококка вымени

TIGR-Tas — компактная фаговая альтернатива CRISPR

При диабете необходимо тщательно контролировать уровень глюкозы в крови. Однако это сложная задача — лишь около трети людей с диабетом 2 типа удается поддерживать данный показатель в безопасном диапазоне. Авторы статьи в The Lancet создали модель , предназначенную для подбора оптимальной стратегии лечения. Модель, исходно обученная на данных ряда клинических испытаний, предсказывает эффективность основных классов противодиабетических препаратов для конкретного пациента, чтобы выбрать среди них...

В ноябре 2024 года в Science опубликовали статью о создании геномной генеративной модели Evo . Этот ИИ способен предсказывать ключевые характеристики той или иной ДНК и генерировать последовательности «с нуля» — как отдельные гены, так и целые геномы. Однако Evo обучали только на прокариотических геномных данных, поэтому генерация также ограничивалась последовательностями, характерными для бактерий и архей. Теперь же на сайте некоммерческой исследовательской организации Arc Institute опубликован...

Рацион питания вычислили по метагеномным данным

Нейроны экономят энергию, синтезируя часть белков в дендритах

Новый алгоритм для анализа транскриптома предлагает перспективные комбинации препаратов против рака

Центр одомашнивания овец «перенесли» из Ирана в Турцию

Листоеды научились переваривать растения благодаря горизонтальному переносу генов

Компьютерный дизайн помог создать белковые антидоты к змеиному яду

Улучшенный метод определения родства по сегментам ДНК идентичного происхождения протестировали на диких макаках

Активность регуляторных элементов в геноме человека научились точно предсказывать по их нуклеотидной последовательности

«Филоволны» отслеживают эволюцию приспособленности патогенов в реальном времени

Как без потерь масштабировать транскриптомику единичных клеток

Аннотация белковых доменов у LUCA позволила установить порядок появления аминокислот в генетическом коде